214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1519 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1519  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  100 
 
 		 481 aa  894    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  47.28 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  45.23 
 
 		 367 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0576  precorrin-3B synthase  47 
 
 		 389 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.244524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  40.88 
 
 		 372 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  40 
 
 		 372 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  35.27 
 
 		 439 aa  201  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  39.86 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  40.38 
 
 		 363 aa  190  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  37.03 
 
 		 378 aa  189  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1783  hypothetical protein  39.13 
 
 		 345 aa  186  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2489  precorrin-3B synthase  39.17 
 
 		 373 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2534  precorrin-3B synthase  39.17 
 
 		 373 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.35067  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2526  precorrin-3B synthase  39.17 
 
 		 373 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17650  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  41.85 
 
 		 292 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220438  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2192  precorrin-3B synthase  38.27 
 
 		 351 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1626  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  47.14 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.470677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  31.02 
 
 		 430 aa  137  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2894  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  42.47 
 
 		 282 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  30.28 
 
 		 469 aa  107  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  31.45 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  22.2 
 
 		 732 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  30.17 
 
 		 431 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  24.03 
 
 		 494 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.87 
 
 		 432 aa  100  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  32.45 
 
 		 476 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  29.38 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  30.75 
 
 		 456 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  30.66 
 
 		 443 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  27.85 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  33.97 
 
 		 423 aa  87  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  20.94 
 
 		 480 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  31.12 
 
 		 479 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  22.2 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2150  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  28.64 
 
 		 478 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  26.85 
 
 		 590 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  29.08 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  22.45 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  29.03 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  25.5 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  25.34 
 
 		 604 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  30.45 
 
 		 486 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3411  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  41.91 
 
 		 207 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  23.39 
 
 		 521 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  29.68 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  25.24 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  24.94 
 
 		 595 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  28.44 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  22.25 
 
 		 553 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  31.04 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  25.67 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  23.34 
 
 		 513 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  25.83 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  32.38 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  23.34 
 
 		 513 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  29.65 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  21.86 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  24.4 
 
 		 513 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  39.42 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  24.49 
 
 		 595 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  21.76 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  27.54 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.41 
 
 		 591 aa  70.9  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  21.24 
 
 		 540 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  24.83 
 
 		 586 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  29.49 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  21.44 
 
 		 540 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  23.74 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  21.66 
 
 		 540 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  27 
 
 		 648 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  21.44 
 
 		 540 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1241  ferredoxin--nitrite reductase  20.27 
 
 		 567 aa  69.3  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.250067  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  31.96 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  24.22 
 
 		 605 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  21.62 
 
 		 540 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  21.46 
 
 		 540 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  23.81 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  21.62 
 
 		 540 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  33.54 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  21.46 
 
 		 540 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  21.66 
 
 		 540 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  23.6 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  36.02 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  23.6 
 
 		 596 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  29.28 
 
 		 482 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  29.55 
 
 		 482 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.34 
 
 		 805 aa  67  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  21.61 
 
 		 536 aa  66.6  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  28.87 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  23.92 
 
 		 590 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  31.49 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  29.51 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  23.49 
 
 		 596 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  33.9 
 
 		 570 aa  64.3  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  31.62 
 
 		 573 aa  63.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  24.1 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  23.5 
 
 		 601 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>