288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2150 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2150  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  100 
 
 		 478 aa  904    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  60.96 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  45.88 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  46.78 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  46.14 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  33.19 
 
 		 443 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  33.18 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  66.67 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  33.33 
 
 		 460 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  24.38 
 
 		 494 aa  117  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  29.76 
 
 		 447 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  27.05 
 
 		 431 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  29.7 
 
 		 476 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.49 
 
 		 432 aa  100  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  25.41 
 
 		 521 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  45 
 
 		 430 aa  92.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  41.67 
 
 		 423 aa  88.6  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  41.76 
 
 		 386 aa  87.8  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  26.85 
 
 		 409 aa  87.8  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  41.56 
 
 		 434 aa  87  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  38.78 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  26.53 
 
 		 586 aa  84  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6019  precorrin-3B synthase  40.65 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0172666  normal  0.33411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.62 
 
 		 568 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.94 
 
 		 565 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  44.86 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  35.58 
 
 		 483 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  35.45 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  33.07 
 
 		 732 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  22.7 
 
 		 513 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  28.93 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  22.7 
 
 		 513 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  36.81 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3285  precorrin-3B synthase  39.41 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  39.42 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  23.74 
 
 		 536 aa  77  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  35.14 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  33.95 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  35.29 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  36.11 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  24.55 
 
 		 605 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  36.11 
 
 		 516 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  56.34 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  23.68 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  38.31 
 
 		 486 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  23.82 
 
 		 595 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  24.26 
 
 		 567 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.73 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.68 
 
 		 570 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1767  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  26.11 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.670459  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  44.44 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  23.15 
 
 		 601 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  23.49 
 
 		 595 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  21.35 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  22.52 
 
 		 516 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  30.46 
 
 		 569 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  28.63 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  44.26 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  45.61 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  44.17 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  32.96 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  24.89 
 
 		 581 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.08 
 
 		 592 aa  63.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  23.64 
 
 		 621 aa  63.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  32.3 
 
 		 599 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  27.14 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  31.43 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.82 
 
 		 569 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  37.75 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  36.31 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  25.16 
 
 		 553 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  31.82 
 
 		 439 aa  60.1  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  33.09 
 
 		 507 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  24.14 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  25.29 
 
 		 571 aa  58.9  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.08 
 
 		 793 aa  58.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  21.26 
 
 		 560 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  20.73 
 
 		 541 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  32.84 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1294  Sulfite reductase (NADPH)  27.82 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.73 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  38.26 
 
 		 473 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  45.76 
 
 		 363 aa  57  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2192  precorrin-3B synthase  57.63 
 
 		 351 aa  57  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  28.95 
 
 		 573 aa  56.6  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2758  Sulfite reductase (NADPH)  29.93 
 
 		 571 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  24.31 
 
 		 596 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0576  precorrin-3B synthase  36.73 
 
 		 389 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.244524  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  25.27 
 
 		 596 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1783  hypothetical protein  34.56 
 
 		 345 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  37.32 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  37.32 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0751  sulfite reductase subunit beta  28 
 
 		 568 aa  55.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  25.98 
 
 		 604 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  37.32 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  37.32 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  28.39 
 
 		 608 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  21.32 
 
 		 540 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0838  sulfite reductase subunit beta  28 
 
 		 568 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1626  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  50 
 
 		 335 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.470677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>