More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1241 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1241  ferredoxin--nitrite reductase  100 
 
 		 567 aa  1169    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.250067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  26.36 
 
 		 521 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  27.2 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  26.41 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  27.33 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  27.33 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  26.19 
 
 		 536 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  26.17 
 
 		 516 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  27.93 
 
 		 553 aa  160  8e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  26.23 
 
 		 513 aa  160  8e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  29.69 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  25.96 
 
 		 513 aa  157  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  27.72 
 
 		 553 aa  157  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  26.41 
 
 		 542 aa  157  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  26.49 
 
 		 542 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  23.95 
 
 		 551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  24.05 
 
 		 615 aa  144  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  26.15 
 
 		 492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.61 
 
 		 793 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  22.74 
 
 		 590 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  25.87 
 
 		 586 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  26.19 
 
 		 586 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  23.95 
 
 		 599 aa  127  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  25.84 
 
 		 633 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  24.25 
 
 		 608 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.84 
 
 		 550 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  26.42 
 
 		 621 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  23.19 
 
 		 648 aa  123  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.4 
 
 		 569 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.58 
 
 		 603 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  24.74 
 
 		 494 aa  120  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  23.05 
 
 		 586 aa  120  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.02 
 
 		 592 aa  120  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  24.66 
 
 		 643 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0512  nitrite/sulfite reductase-like protein  27.37 
 
 		 516 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.41 
 
 		 589 aa  118  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.06 
 
 		 591 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  23.63 
 
 		 639 aa  117  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.82 
 
 		 590 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  26.12 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  25.24 
 
 		 560 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  24.07 
 
 		 521 aa  114  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  25.42 
 
 		 540 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  25.42 
 
 		 540 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  24.76 
 
 		 519 aa  113  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  25.05 
 
 		 540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2637  sulfite reductase (NADPH)  26.38 
 
 		 713 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.05 
 
 		 562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  25.05 
 
 		 540 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  24.74 
 
 		 560 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  25.24 
 
 		 540 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  22.29 
 
 		 553 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  25.24 
 
 		 540 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.01 
 
 		 805 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  24.86 
 
 		 540 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.35 
 
 		 573 aa  111  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.78 
 
 		 568 aa  110  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  23.03 
 
 		 604 aa  110  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  25.24 
 
 		 540 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  24.75 
 
 		 540 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  25.63 
 
 		 540 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1504  sulfite reductase (ferredoxin)  23.87 
 
 		 696 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361579  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  24.24 
 
 		 560 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0526  nitrite/sulfite reductase-like protein  27.22 
 
 		 516 aa  108  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.574671  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  23.67 
 
 		 560 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  23.67 
 
 		 560 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  25.35 
 
 		 732 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  24.77 
 
 		 560 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  21.86 
 
 		 605 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  23.37 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  21.9 
 
 		 595 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  24.29 
 
 		 591 aa  104  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.91 
 
 		 565 aa  104  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.51 
 
 		 757 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  22.65 
 
 		 595 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  22.13 
 
 		 596 aa  103  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.94 
 
 		 590 aa  103  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6980  sulfite/ferredoxin-nitrite reductase  22.33 
 
 		 551 aa  103  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  22.11 
 
 		 601 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1146  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.91 
 
 		 697 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  22.11 
 
 		 596 aa  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  22.66 
 
 		 560 aa  102  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  22.94 
 
 		 569 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.45 
 
 		 592 aa  101  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  22.91 
 
 		 564 aa  100  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2201  sulfite reductase subunit beta  24.72 
 
 		 573 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  23.73 
 
 		 571 aa  99.4  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5531  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  21.83 
 
 		 609 aa  99.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  22.86 
 
 		 573 aa  99.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  22.7 
 
 		 556 aa  98.6  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1153  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  22.27 
 
 		 555 aa  97.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3991  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  21.86 
 
 		 556 aa  97.1  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661802  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  21.9 
 
 		 590 aa  97.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  21.83 
 
 		 586 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  24.54 
 
 		 569 aa  95.1  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  22.51 
 
 		 556 aa  94.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0485  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.97 
 
 		 490 aa  94.7  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  23.22 
 
 		 586 aa  94.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  23.85 
 
 		 569 aa  94.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6617  Sulfite reductase (ferredoxin)  21.81 
 
 		 704 aa  93.6  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00459026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>