More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0542 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0542  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 292 aa  597  1e-170  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0630058  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0701  porphobilinogen deaminase  55.86 
 
 		 298 aa  318  9e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.141584  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0354  porphobilinogen deaminase  53.95 
 
 		 298 aa  311  1e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  45.23 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  42.86 
 
 		 309 aa  235  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3202  porphobilinogen deaminase  42.23 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1349  porphobilinogen deaminase  45.61 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751939 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  42.76 
 
 		 315 aa  229  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  43.3 
 
 		 320 aa  228  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  43.3 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  43.3 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3845  porphobilinogen deaminase  42.33 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  43.3 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  43.3 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  43.16 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  43.3 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  42.96 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  42.96 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  42.96 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31592  predicted protein  43 
 
 		 325 aa  223  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.784447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  42.96 
 
 		 322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  42.61 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  42.61 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  42.61 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  42.61 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  42.61 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  42.86 
 
 		 313 aa  219  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  42.61 
 
 		 310 aa  218  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  40 
 
 		 311 aa  218  8.999999999999998e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  42.27 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  42.18 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2660  porphobilinogen deaminase  40.93 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  41.08 
 
 		 318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2791  porphobilinogen deaminase  40.93 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  42.61 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  44.56 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  39.73 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2704  porphobilinogen deaminase  40.4 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  41.92 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  42.96 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2334  porphobilinogen deaminase  42.91 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69155  normal  0.249742 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  42.27 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  41.92 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0551  porphobilinogen deaminase  42.57 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0406  porphobilinogen deaminase  40.4 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5394  porphobilinogen deaminase  41.92 
 
 		 309 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  41.36 
 
 		 313 aa  212  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  38.49 
 
 		 309 aa  212  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  40.78 
 
 		 307 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  42.25 
 
 		 318 aa  211  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  41.58 
 
 		 313 aa  211  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1234  porphobilinogen deaminase  39.38 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0387484  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1762  porphobilinogen deaminase  44.67 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1728  porphobilinogen deaminase  44.67 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  41.58 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  42.66 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  40.69 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  41.4 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  41.98 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  41.98 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51811  hydroxymethylbilane synthase  40 
 
 		 329 aa  210  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  43.31 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2529  porphobilinogen deaminase  42.16 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  39.31 
 
 		 309 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  42.66 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1022  porphobilinogen deaminase  41.16 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  39.66 
 
 		 314 aa  208  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  42.75 
 
 		 317 aa  208  8e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  41.49 
 
 		 326 aa  208  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0679  porphobilinogen deaminase  42.57 
 
 		 314 aa  208  9e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  40 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  40.49 
 
 		 318 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  42.96 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3568  porphobilinogen deaminase  38.74 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  42.7 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  38.57 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  40.14 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  38.85 
 
 		 322 aa  206  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  42.41 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  39.93 
 
 		 316 aa  205  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 312 aa  205  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  40.48 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  41.32 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  41.32 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  46.53 
 
 		 313 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  42.05 
 
 		 311 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  42.11 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  44.23 
 
 		 313 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  45 
 
 		 313 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  45 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  41.13 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  39.19 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  39.52 
 
 		 309 aa  202  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  39.72 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  39.8 
 
 		 309 aa  201  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  38.78 
 
 		 330 aa  201  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0098  porphobilinogen deaminase  43.27 
 
 		 345 aa  201  9e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  41.55 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3630  porphobilinogen deaminase  41.22 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>