200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0239 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0239  N utilization substance protein B, putative  100 
 
 		 160 aa  323  6e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0784  putative N utilization substance protein B  35.92 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0291  hypothetical protein  35.71 
 
 		 148 aa  84  8e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2025  NusB antitermination factor  30.56 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0100858 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  34.72 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0634  transcription antitermination protein NusB  33.09 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0820707  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2775  NusB antitermination factor  38.54 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2676  transcription antitermination protein NusB  27.45 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0143299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2127  NusB antitermination factor  28.26 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3009  transcription antitermination protein NusB  26.57 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2639  transcription antitermination protein NusB  27.1 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.093311  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  32.85 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1401  NusB/RsmB/TIM44  35.92 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979954 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4281  NusB antitermination factor  27.4 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.996449  normal  0.0149277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3044  transcription antitermination protein NusB  32.17 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  40.7 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  33.33 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  32.23 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1819  transcription antitermination protein NusB  28.57 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2914  NusB antitermination factor  37.65 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00764902  hitchhiker  0.00305914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2664  transcription antitermination protein NusB  25.83 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0957434  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4644  transcription antitermination protein NusB  26.57 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187095  normal  0.435075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  33.82 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  29.33 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  31.91 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  28.06 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  31.94 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0207  NusB antitermination factor  29.29 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0827539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0822  transcription antitermination protein NusB  28.47 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.932634  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  38.46 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4924  NusB antitermination factor  38.89 
 
 		 388 aa  54.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  35.71 
 
 		 325 aa  54.3  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1191  transcription antitermination protein NusB  28.38 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1722  transcription antitermination protein NusB  27.27 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.0484184 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3536  NusB antitermination factor  25.95 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  39.77 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  26.39 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2921  NusB antitermination factor  36.67 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  33.98 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0770  transcription antitermination protein NusB  28.26 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  28.99 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0880  putative N utilization substance protein B  26.39 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.150088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  28.99 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  28.99 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2249  N utilization substance protein B-like protein  25.18 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.561904 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0763  transcription antitermination protein NusB  28.26 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  30.41 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  32.64 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1139  transcription antitermination protein NusB  32.86 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6801  NusB antitermination factor  26.71 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  37.76 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7540  NusB antitermination factor  26.71 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00424485  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1280  transcription antitermination protein NusB  28.38 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0659  NusB antitermination factor  27.08 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6330  NusB antitermination factor  34.69 
 
 		 378 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0422  NusB antitermination factor  24.11 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  39.53 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  40.96 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  29.05 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  33.7 
 
 		 130 aa  51.6  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1531  transcription antitermination protein NusB  32.97 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0468647  normal  0.834868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  28.08 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  30.77 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2412  NusB antitermination factor  22.7 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0755  NusB antitermination factor  22.7 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  35.96 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  40.96 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  34.31 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  35.42 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  27.7 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2117  NusB antitermination factor  26.97 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2525  transcription antitermination protein NusB  27.86 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0010  transcription antitermination protein NusB  34.52 
 
 		 211 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01170  transcription antitermination protein NusB  29.25 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  28.08 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  36.96 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  38.37 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  31.39 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  28.08 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  28.08 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1620  transcription antitermination protein NusB  26.49 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  28.06 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0010  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 211 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.728804  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  30.34 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3412  NusB antitermination factor  23.65 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.45885  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  27.4 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0807  NusB family protein  37.65 
 
 		 364 aa  48.5  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  27.46 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  33.72 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>