More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0058 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  100 
 
 		 154 aa  322  8.000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  51.8 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  42.21 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  41.89 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  46.67 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  41.89 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  42.96 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  42.96 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  42.54 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  38.85 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  41.18 
 
 		 145 aa  104  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  40.31 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  40.77 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  43.41 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  36.96 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  34.64 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  40.15 
 
 		 138 aa  101  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  40.14 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  40.14 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  40.14 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  36.23 
 
 		 135 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  40.31 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  35.56 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  36.99 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  37.32 
 
 		 162 aa  94  7e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  35 
 
 		 153 aa  92  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  34.72 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  39.23 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 130 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  37.59 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  36.36 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  39.85 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  36.17 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  35.04 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  33.85 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  40.15 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  33.81 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  46.51 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  39.55 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  34.31 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  37.01 
 
 		 195 aa  88.2  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  34.35 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  36.03 
 
 		 183 aa  87.4  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  34.85 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  32.61 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  35.66 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  43.48 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  35.66 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  36.72 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  37.41 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  40.31 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  39.22 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  40.31 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  35.61 
 
 		 132 aa  86.3  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  34.56 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  39.22 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  40.31 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  40.31 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  39.22 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  33.83 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  42.57 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  40.31 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  37.98 
 
 		 132 aa  85.5  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  37.23 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  31.88 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1532  transcription termination/antitermination factor NusB  40.14 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.318402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  40.31 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  45.12 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  34.11 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  34.56 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  43.18 
 
 		 135 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  35.66 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  39.1 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  34.56 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  35.25 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  36.3 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  35.25 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  42.17 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1100  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000596608  normal  0.728168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1166  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00313304  normal  0.241653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1100  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000020777  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  40.86 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  41.57 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  35.61 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  32.81 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>