More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1333 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 131 aa  263  5.999999999999999e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  66.67 
 
 		 132 aa  170  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  63.85 
 
 		 131 aa  170  7.999999999999999e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  65.89 
 
 		 132 aa  169  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  65.89 
 
 		 132 aa  168  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0541  transcription antitermination protein NusB  61.24 
 
 		 132 aa  164  5e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1180  transcription antitermination protein NusB  60.16 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  56.92 
 
 		 136 aa  151  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  56.15 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0784  transcription antitermination protein NusB  56.25 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  40.15 
 
 		 154 aa  90.1  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  35.34 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  36.84 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  34.13 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  32.84 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  35.61 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  34.62 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  35.51 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  35.51 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  35.51 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  35.51 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  35.51 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  35.51 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  32.59 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  35.51 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  35.51 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  35.51 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1100  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000596608  normal  0.728168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1166  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00313304  normal  0.241653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1100  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000020777  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  32.54 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  32.54 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  32.54 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  32.54 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  32.56 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  34.65 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  32.54 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  29.23 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  32.56 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  30.3 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  31.78 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0584  transcription antitermination protein NusB  35.48 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  28.79 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  28.91 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  36.26 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  31.5 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  31.5 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  31.58 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  31.75 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  32.81 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  33.85 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  31.75 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  31.06 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  33.59 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  31.85 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0603  transcription antitermination protein NusB  32.28 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.016248  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  31.06 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  32.37 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1444  NusB antitermination factor  31.54 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  31.75 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  34.78 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  31.43 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0107  transcription antitermination protein NusB  37.12 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1074  transcription antitermination protein NusB  32.52 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547473  hitchhiker  0.000302454 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  32.03 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  37.93 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  29.46 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  33.87 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  30.77 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  30 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  30.77 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  30.77 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  30.77 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  43.02 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  32.56 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  31.78 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1532  transcription termination/antitermination factor NusB  34.85 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.318402  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  30.5 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  31.25 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  36.05 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  36.05 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  36.3 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  36.3 
 
 		 135 aa  66.6  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  37.65 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  30.53 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  27.69 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  30.23 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  29.92 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2897  transcription antitermination protein NusB  33.61 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  33.59 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>