More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_2830 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  100 
 
 
142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  100 
 
 
142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  100 
 
 
142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  88.49 
 
 
143 aa  249  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  51.13 
 
 
151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  48.53 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  48.95 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  50.39 
 
 
142 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  48.53 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  47.29 
 
 
143 aa  116  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  48.85 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  47.14 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  44.37 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  46.43 
 
 
145 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  42.96 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  42.96 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  48.09 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  42.28 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  41.48 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  38.03 
 
 
141 aa  108  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  44.78 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  41.13 
 
 
140 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  44.09 
 
 
143 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  47.29 
 
 
150 aa  103  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  42.96 
 
 
150 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  44.03 
 
 
133 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  41.01 
 
 
153 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  45.24 
 
 
145 aa  100  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  40.14 
 
 
154 aa  100  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  44.03 
 
 
130 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  44.53 
 
 
138 aa  98.2  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  38.52 
 
 
135 aa  98.6  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  37.59 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  38.52 
 
 
135 aa  98.2  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  38.81 
 
 
140 aa  97.4  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  38.13 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  39.29 
 
 
147 aa  97.1  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  38.69 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  38.69 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  36.81 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  40.62 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  37.96 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  41.98 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  37.96 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  37.96 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  37.96 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  37.96 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  37.96 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  37.96 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  37.96 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  36.15 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  36.69 
 
 
139 aa  94  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  36.11 
 
 
142 aa  94  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  42.19 
 
 
183 aa  93.6  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  36.96 
 
 
165 aa  93.6  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  43.38 
 
 
195 aa  92  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  36.96 
 
 
171 aa  91.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  39.86 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  40.91 
 
 
190 aa  92  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  42.96 
 
 
165 aa  91.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  41.04 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  42.86 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  38.41 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  41.3 
 
 
164 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  43.31 
 
 
145 aa  90.5  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  36.23 
 
 
169 aa  90.1  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  39.55 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  39.57 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  36.72 
 
 
129 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  36.76 
 
 
163 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  37.23 
 
 
130 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  36.72 
 
 
144 aa  88.2  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  36.43 
 
 
136 aa  87.8  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1002  NusB antitermination factor  30.56 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  38.46 
 
 
142 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  46.07 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  43.82 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  36.69 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  39.26 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  34.53 
 
 
168 aa  87  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  39 
 
 
209 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0584  transcription antitermination protein NusB  42.31 
 
 
159 aa  87.4  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708112  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  42.42 
 
 
162 aa  87  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  37.01 
 
 
134 aa  87  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  38.64 
 
 
136 aa  86.7  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3454  transcription antitermination protein NusB  41.41 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262306 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  39.84 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  42.27 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  36.43 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  36.43 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  36.23 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  41.73 
 
 
135 aa  84.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  36.36 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1396  NusB antitermination factor  39.1 
 
 
161 aa  85.5  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  39.39 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  36.69 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  57.14 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  39.52 
 
 
144 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0603  transcription antitermination protein NusB  40.71 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.016248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2897  transcription antitermination protein NusB  42.75 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>