More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1628 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  100 
 
 		 138 aa  278  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  79.71 
 
 		 138 aa  235  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  63.89 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  58.33 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  57.89 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  57.64 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  53.28 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  46.1 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  48.25 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  48.18 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  43.24 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  47.58 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  48.53 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  48.53 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  48.53 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  50 
 
 		 143 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  46.97 
 
 		 155 aa  116  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  50.4 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  48.87 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  44.12 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  44.27 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  39.86 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  40.44 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  41.98 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  45.86 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  40.97 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  44.44 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  38.81 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  44.7 
 
 		 130 aa  103  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  38.06 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  35.37 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  37.31 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  43.88 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  37.96 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  40.15 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  45.99 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  40.44 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  38.93 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  42.64 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  44.96 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  41.98 
 
 		 190 aa  99.8  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  40.44 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  41.98 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  42.45 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  43.17 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  35.92 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  37.78 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  40.44 
 
 		 156 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  41.67 
 
 		 183 aa  97.4  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  36.64 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  42.42 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  40.77 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  40.15 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  41.55 
 
 		 195 aa  95.5  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  43.17 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  41.79 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  39.84 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  38.28 
 
 		 134 aa  94.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  40 
 
 		 163 aa  94  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  36.15 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  40.44 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  40.71 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  41.73 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  41.13 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  39.39 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  34.33 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  34.81 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  34.81 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  34.81 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 136 aa  90.5  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  37.01 
 
 		 135 aa  90.9  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  43.18 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  50 
 
 		 135 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  40.15 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  37.59 
 
 		 146 aa  90.5  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  47.56 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  36.5 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  36.03 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  35.82 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  34.81 
 
 		 138 aa  87.4  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  38.71 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  39.55 
 
 		 130 aa  87  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  40.31 
 
 		 160 aa  86.7  9e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  37.68 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0698  NusB antitermination factor  36.99 
 
 		 169 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  37.69 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  37.9 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  35.43 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  36.03 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  35.88 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>