More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_06300 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  100 
 
 		 134 aa  271  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  38.89 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  37.01 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  35.82 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  42.06 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  35 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  34.33 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  36.92 
 
 		 166 aa  87.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  34.85 
 
 		 154 aa  87.4  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  36.84 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  38.58 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  38.93 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  34 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  38.28 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  35.61 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  36 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  36.64 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  36.84 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  35.61 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  35.61 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  37.78 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  48.28 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  38.81 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  32.09 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  45.24 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  35.61 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  35.61 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  35.61 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  35.61 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  33.57 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  35.61 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  35.61 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  35.61 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  36.15 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  32.87 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  36.15 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  36.64 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  36.15 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  34.85 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  34.53 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  37.21 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  37.88 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  35.11 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  32.58 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  34.56 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  33.83 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  33.57 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  35.61 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  34.78 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  35.61 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  36.76 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  42.53 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  37.4 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  33.58 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  30.43 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  32.58 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  41.67 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  35.82 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  42.53 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  34.35 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  33.85 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  43.18 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1180  transcription antitermination protein NusB  32.82 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1038  NusB antitermination factor  34.56 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000780031  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  34.09 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  32.81 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  42.17 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  34.56 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  39.08 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  29.37 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  28.57 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  33.82 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  37.59 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  29.37 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  34.09 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  35.77 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  35.82 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  39.77 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  35.38 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  37.88 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  33.8 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  37.88 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  42.86 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  40.23 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  35.88 
 
 		 190 aa  73.9  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  29.69 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  40.7 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  29.69 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  29.69 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  30.23 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  34.27 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  34.38 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  34.65 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  40.48 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  36.03 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  30 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>