More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1679 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  100 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  89.94 
 
 		 165 aa  291  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  83.44 
 
 		 171 aa  284  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  84.47 
 
 		 164 aa  281  3.0000000000000004e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  82.21 
 
 		 169 aa  273  6e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  73.29 
 
 		 168 aa  248  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  74.51 
 
 		 168 aa  241  3e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  51.7 
 
 		 165 aa  154  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  39.46 
 
 		 151 aa  104  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  38.52 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6330  NusB antitermination factor  42.52 
 
 		 378 aa  98.2  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  43.07 
 
 		 145 aa  98.2  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  42.34 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  39.26 
 
 		 195 aa  95.9  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  37.98 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4924  NusB antitermination factor  48.11 
 
 		 388 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  35.07 
 
 		 139 aa  94  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  42.45 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  40.85 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  38.97 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  41.73 
 
 		 138 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  40 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  36.57 
 
 		 135 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  42.64 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  35.82 
 
 		 135 aa  91.3  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  41.01 
 
 		 142 aa  91.3  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  36.69 
 
 		 133 aa  90.9  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  40.15 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  40.29 
 
 		 142 aa  89.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  36.76 
 
 		 142 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  36.76 
 
 		 142 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  33.8 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  36.76 
 
 		 142 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  37.12 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  40 
 
 		 143 aa  87.4  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  35.46 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  35.61 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  36.55 
 
 		 143 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  38.64 
 
 		 130 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  38.81 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  38.64 
 
 		 130 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  34.85 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  37.23 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  38.64 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  38.64 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  38.64 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  38.64 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  38.64 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  38.64 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  36.57 
 
 		 140 aa  84.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  36.92 
 
 		 143 aa  84.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  40.77 
 
 		 154 aa  84.7  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2447  antitermination factor  50.62 
 
 		 389 aa  84.3  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351781  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  36.64 
 
 		 153 aa  84.3  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  38.64 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  36.62 
 
 		 146 aa  84.3  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12923  putative N utilization substance protein  51.76 
 
 		 302 aa  84.3  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  35.11 
 
 		 134 aa  84  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  35.11 
 
 		 162 aa  84  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  35.38 
 
 		 141 aa  84  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  35.11 
 
 		 162 aa  84  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  35.11 
 
 		 162 aa  84  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  36.96 
 
 		 130 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  36.67 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0422  hypothetical protein  39.1 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  36.76 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1966  N utilization substance protein B  37.61 
 
 		 302 aa  81.6  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0692003  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  36.36 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1401  NusB/RsmB/TIM44  43.14 
 
 		 316 aa  80.9  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979954 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  36.69 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  33.8 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  35.62 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  35.16 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  36.09 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  34.59 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  35.9 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2202  transcription termination factor-like protein  54.32 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  34.53 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  35.29 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  34.13 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  38.68 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  31.3 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  35.11 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  30.94 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_002950  PG0807  NusB family protein  39.23 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6247  NusB antitermination factor  37.3 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  31.39 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  35.38 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  34.4 
 
 		 145 aa  77  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  30.5 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  29.19 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  34.09 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3283  transcription antitermination protein NusB  38.02 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  36.92 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1027  transcription antitermination protein NusB  38.02 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  35.94 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  30.43 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  35.16 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  29.79 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  35.16 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>