More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1215 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  100 
 
 		 146 aa  298  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  39.72 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  38.57 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  36.91 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  38.13 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  38.13 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  38.13 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  38.97 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  38.24 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  42.19 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  41.01 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  40.91 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  38.41 
 
 		 155 aa  95.1  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  38.97 
 
 		 145 aa  94.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  34.78 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  37.96 
 
 		 143 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  39.85 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  39.55 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  36.84 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  39.29 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  38.76 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  37.31 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  37.59 
 
 		 138 aa  90.5  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  37.69 
 
 		 145 aa  90.1  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  36.57 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  36.57 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  37.14 
 
 		 168 aa  88.2  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  38.13 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  35.46 
 
 		 168 aa  87  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  39.53 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  34.56 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  36.62 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4924  NusB antitermination factor  42.57 
 
 		 388 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  37.88 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  35.77 
 
 		 164 aa  83.6  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  31.82 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  32.82 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2202  transcription termination factor-like protein  40.78 
 
 		 303 aa  81.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  34.31 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  35.14 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  37.14 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  31.85 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  32.33 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  31.91 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  32.61 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  32.61 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  38.78 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  34.85 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12923  putative N utilization substance protein  39.8 
 
 		 302 aa  78.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  32.06 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  36.8 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2447  antitermination factor  36.17 
 
 		 389 aa  78.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351781  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  31.08 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  33.09 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6247  NusB antitermination factor  35.42 
 
 		 309 aa  77.8  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  29.85 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  32.85 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  27.92 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1002  NusB antitermination factor  29.63 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  32.56 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  39.39 
 
 		 212 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  43.02 
 
 		 211 aa  76.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  30.77 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  37.01 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  33.83 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  43.02 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.705133 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  30.67 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  29.69 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  32.56 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  29.41 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  30.22 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  31.94 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0698  NusB antitermination factor  33.57 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  34.11 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0107  transcription antitermination protein NusB  32.37 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  37.4 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  30.83 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  35.51 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  35.43 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1038  NusB antitermination factor  33.83 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000780031  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6330  NusB antitermination factor  35.92 
 
 		 378 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  43.84 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  31.06 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  37.74 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  30.83 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0422  hypothetical protein  36.67 
 
 		 378 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>