More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1616 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  100 
 
 		 137 aa  278  3e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  49.24 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1238  transcription termination factor  39.84 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  39.31 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0750  transcription termination factor  36.64 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.906803  hitchhiker  0.00118755 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  37.06 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  37.01 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  36.57 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  41.54 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  39.52 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  36.57 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  39.55 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  36.57 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  36.57 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  36.57 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  36.57 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  36.57 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  36.57 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  36.57 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  36.36 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  39.52 
 
 		 130 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  41.27 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  35.07 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  39.69 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  39.69 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  32.19 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  36.69 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  37.21 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004261  transcription termination protein NusB  36.17 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00012061  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  37.88 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  39.2 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01170  transcription antitermination protein NusB  35.71 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  37.4 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  41.76 
 
 		 325 aa  80.5  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  35.07 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  37.4 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  38.81 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  38.89 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  38.1 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  33.09 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  35.38 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  36.64 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  34.25 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  40 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  37.69 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  39.06 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  35.71 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  36.57 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  37.21 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  36.09 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  38.64 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  43.33 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  37.01 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  35.34 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  37.01 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  34.62 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  37.01 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  34.35 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0579  transcription antitermination protein NusB  37.31 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1578  transcription antitermination protein NusB  37.31 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000076307  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  36.64 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  32.37 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3088  transcription antitermination protein NusB  46.99 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3283  transcription antitermination protein NusB  39.67 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  34.65 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  36.09 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  37.4 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  35.11 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  32.58 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  35.11 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  34.06 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1857  transcription antitermination protein NusB  46.99 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0201856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2897  transcription antitermination protein NusB  46.99 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  33.86 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  36.76 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  34.31 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1315  transcription antitermination protein NusB  35.88 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1166  transcription antitermination protein NusB  35.97 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000379162  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  31.82 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  32.58 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3853  transcription antitermination protein NusB  36.92 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  35.07 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  32.61 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  42.17 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1100  transcription antitermination protein NusB  36.64 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000596608  normal  0.728168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1166  transcription antitermination protein NusB  36.64 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00313304  normal  0.241653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1100  transcription antitermination protein NusB  36.64 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000020777  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1027  transcription antitermination protein NusB  38.84 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  32.61 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  34.85 
 
 		 195 aa  70.1  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0603  transcription antitermination protein NusB  34.75 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.016248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>