More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3504 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  100 
 
 		 148 aa  299  7.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  50.35 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  49.64 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  46.76 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  48.18 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  48.12 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  46.97 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  43.66 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  45.31 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  46.09 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  45.26 
 
 		 138 aa  117  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  48.85 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  48.85 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  48.85 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  40 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  40.69 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  47.33 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  43.08 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  43.51 
 
 		 145 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  45.93 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  45.04 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  46.92 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  46.92 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  46.92 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  46.92 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  46.92 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  46.92 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  45.52 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  46.92 
 
 		 130 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  44.78 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  44.78 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  41.67 
 
 		 195 aa  107  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  45.74 
 
 		 142 aa  103  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  42.34 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  40.58 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  40.14 
 
 		 166 aa  102  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  44.96 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  34.51 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  43.28 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  35.21 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  36.92 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  37.14 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  37.59 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  41.09 
 
 		 168 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  36.43 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  37.14 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  41.43 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  39.01 
 
 		 156 aa  98.2  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  43.51 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  39.13 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  36.88 
 
 		 154 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  41.09 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  41.43 
 
 		 150 aa  96.7  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  38.81 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  37.4 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  38.64 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  37.69 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  37.69 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  41.01 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  45.93 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  36.36 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  40 
 
 		 168 aa  94.7  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  38.41 
 
 		 190 aa  94.4  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  42.75 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  35.56 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  38.46 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  38.13 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  36.03 
 
 		 165 aa  92  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  38.76 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  37.69 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  38.57 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  40.3 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  38.64 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  39.69 
 
 		 165 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  47.13 
 
 		 135 aa  91.3  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  38.35 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  39.69 
 
 		 138 aa  90.5  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  36.73 
 
 		 165 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  36.36 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  38.46 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  35.29 
 
 		 135 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  39.69 
 
 		 171 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  37.76 
 
 		 183 aa  89.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  38.52 
 
 		 163 aa  89.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  35.29 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  37.59 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  40.46 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  38.24 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  36.62 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  36.84 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  36.84 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  35.29 
 
 		 167 aa  88.6  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  36.84 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  36.84 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  36.84 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  36.13 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>