More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1069 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  100 
 
 		 143 aa  290  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  51.09 
 
 		 138 aa  147  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  48.51 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  51.15 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  49.64 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  49.62 
 
 		 133 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  50.78 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  48 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  46.56 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  46.56 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  45.8 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  45.8 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  45.8 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  45.8 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  45.8 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  45.8 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  45.8 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  45.8 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  45.8 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  43.41 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  43.28 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  46.62 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  43.28 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  50.4 
 
 		 138 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  49.6 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  43.7 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  47.69 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  39.06 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  45.19 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  40.58 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  41.35 
 
 		 134 aa  107  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  35.77 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  44.09 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  44.09 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  44.09 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  43.41 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  44.96 
 
 		 195 aa  100  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  43.45 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  40.74 
 
 		 147 aa  100  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  41.79 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  38.76 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  36.72 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  42.96 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  41.22 
 
 		 171 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  39.06 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  39.69 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  36.84 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  39.37 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  42.14 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  37.32 
 
 		 147 aa  97.4  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  36.69 
 
 		 165 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  42.19 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  36.15 
 
 		 135 aa  94.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  37.5 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  39.23 
 
 		 165 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  35.11 
 
 		 138 aa  93.6  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  35.82 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  37.01 
 
 		 143 aa  93.6  8e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  36.22 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  35.07 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  37.31 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  35.51 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  35.66 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  39.53 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  37.88 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  36.22 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  35.38 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  40 
 
 		 169 aa  90.9  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  38.46 
 
 		 164 aa  90.9  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  39.23 
 
 		 154 aa  90.5  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  33.57 
 
 		 167 aa  90.5  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  37.12 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  35.71 
 
 		 156 aa  90.5  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  40.59 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  35.38 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  34.65 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  41.75 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1563  NusB antitermination factor  36.64 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  35.66 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  34.35 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  35.85 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  33.83 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  35.66 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  36.57 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  36.8 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  34.56 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2897  transcription antitermination protein NusB  37.19 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  35.94 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  34.72 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  34.72 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  34.72 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  36.36 
 
 		 129 aa  84.3  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  36.92 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  34.75 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  34.51 
 
 		 190 aa  84.3  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3088  transcription antitermination protein NusB  37.19 
 
 		 139 aa  83.6  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>