More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0083 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  100 
 
 
190 aa  379  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  68.49 
 
 
160 aa  206  1e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  52.67 
 
 
138 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  53.38 
 
 
138 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  52.67 
 
 
138 aa  143  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  49.62 
 
 
138 aa  137  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  51.91 
 
 
135 aa  136  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  51.18 
 
 
153 aa  131  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  45.8 
 
 
135 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  45.74 
 
 
139 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  46.46 
 
 
145 aa  121  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  46.72 
 
 
136 aa  120  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  45.99 
 
 
136 aa  118  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  44.27 
 
 
153 aa  118  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  44.93 
 
 
145 aa  117  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  45.11 
 
 
144 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  43.51 
 
 
137 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  44.8 
 
 
136 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  44.27 
 
 
138 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  42.75 
 
 
142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  44.7 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  41.98 
 
 
162 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  41.98 
 
 
162 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  41.98 
 
 
162 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  42.75 
 
 
150 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  50.5 
 
 
135 aa  104  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  40.94 
 
 
136 aa  104  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  42.28 
 
 
137 aa  104  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  41.94 
 
 
144 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  40.91 
 
 
164 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  41.35 
 
 
165 aa  101  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  41.22 
 
 
136 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  41.98 
 
 
138 aa  99.8  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  41.73 
 
 
139 aa  99.8  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  40.15 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  39.69 
 
 
136 aa  99.4  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  47.12 
 
 
135 aa  98.6  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  40.46 
 
 
156 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14710  transcription antitermination factor NusB  39.85 
 
 
178 aa  95.1  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  38.93 
 
 
138 aa  94.7  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  38.41 
 
 
148 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  40.31 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  35.77 
 
 
145 aa  92.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  35.71 
 
 
143 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  43.94 
 
 
143 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  40.91 
 
 
142 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  40.91 
 
 
142 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  40.91 
 
 
142 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  40.44 
 
 
151 aa  91.7  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  36.17 
 
 
155 aa  90.9  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  42.19 
 
 
142 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  36.03 
 
 
147 aa  90.1  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  46.59 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  35.16 
 
 
130 aa  89.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  33.07 
 
 
136 aa  87.8  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  32.09 
 
 
134 aa  87.8  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  35.34 
 
 
130 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  35.34 
 
 
130 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  35.34 
 
 
130 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  35.34 
 
 
130 aa  87.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  35.34 
 
 
130 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  35.34 
 
 
130 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  35.34 
 
 
130 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  35.34 
 
 
130 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  34.56 
 
 
145 aa  87.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  35.34 
 
 
130 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  38.52 
 
 
162 aa  86.3  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  34.21 
 
 
145 aa  86.3  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  33.99 
 
 
183 aa  85.1  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  34.59 
 
 
130 aa  84.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  29.2 
 
 
144 aa  83.6  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  35.07 
 
 
143 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  34.33 
 
 
143 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  34.51 
 
 
143 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  37.69 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  35.66 
 
 
138 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  35.77 
 
 
145 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  33.58 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  28.68 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  35.66 
 
 
153 aa  82  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  35.94 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  36.3 
 
 
133 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  33.58 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  32.84 
 
 
171 aa  80.9  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  36.09 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  34.31 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  29.77 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  31.43 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  39.05 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  35.04 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  48.72 
 
 
132 aa  79  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  32.87 
 
 
139 aa  79  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  31.54 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  31.3 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  38.68 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  41.11 
 
 
211 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  33.33 
 
 
145 aa  77  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  41.11 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.705133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>