More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0283 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  100 
 
 		 150 aa  302  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  73.94 
 
 		 142 aa  216  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  75.74 
 
 		 142 aa  215  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  60.28 
 
 		 146 aa  166  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  43.94 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  42.42 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  42.42 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  41.09 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  42.74 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  45.31 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  42.96 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  42.96 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  42.96 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  39.86 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  40.43 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  35.88 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  39.22 
 
 		 195 aa  94  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  37.4 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  39.55 
 
 		 162 aa  90.1  9e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  34.31 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  38.17 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  39.2 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  35.66 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  33.58 
 
 		 142 aa  87.4  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  41.98 
 
 		 163 aa  87.4  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  40.31 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  35.42 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0107  transcription antitermination protein NusB  31.06 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  35.92 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  37.76 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  35.38 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  33.1 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  33.58 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  37.86 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  39.23 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2438  NusB antitermination factor  34.48 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  37.9 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  36.92 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  37.59 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  35.66 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  36.43 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  40.77 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1444  NusB antitermination factor  36.17 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  34.11 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  34.09 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  34.09 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  35.82 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  34.09 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  39.06 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  36.17 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  37.59 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  36.09 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  33.8 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  34.09 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  39.29 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  34.09 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  34.56 
 
 		 163 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  38.35 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  32.31 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  35.82 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  35.11 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  35.2 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  31.54 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  35.11 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  33.59 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  33.85 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  34.43 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  35.04 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  36.08 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  30.77 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  35.37 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  34.11 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  35.71 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  37.59 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  27.86 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  34.59 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  32.59 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  34.81 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  32.31 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  33.83 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>