More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1449 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  100 
 
 		 156 aa  315  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  47.97 
 
 		 138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  44.3 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  43.24 
 
 		 138 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  47.22 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  43.45 
 
 		 145 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  42.28 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  42.28 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  42.28 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  42.76 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  42.67 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  42.57 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  46.34 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  45.53 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  39.86 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  38.89 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  36.91 
 
 		 146 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  43.06 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  36.55 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  39.01 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  38.41 
 
 		 150 aa  97.4  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  41.13 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  37.33 
 
 		 165 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  37.59 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  39.1 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  36.24 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  34.01 
 
 		 145 aa  94.4  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  36 
 
 		 141 aa  94.4  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  40.28 
 
 		 139 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  38.62 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  38.62 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  45.16 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  38.62 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  38.62 
 
 		 130 aa  91.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  38.62 
 
 		 130 aa  91.7  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  38.62 
 
 		 130 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  38.62 
 
 		 130 aa  91.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  38.62 
 
 		 130 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  46.67 
 
 		 144 aa  91.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  38.62 
 
 		 130 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  34.25 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  36.49 
 
 		 153 aa  90.9  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0107  transcription antitermination protein NusB  38.51 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  36.57 
 
 		 134 aa  90.5  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  35.71 
 
 		 143 aa  90.5  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  36.17 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  41.3 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  37.24 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  40.71 
 
 		 138 aa  90.1  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  36.49 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  34.72 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  37.5 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  34.25 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  45.35 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  34.62 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  38.58 
 
 		 147 aa  87.8  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  36.88 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  36.17 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  36.88 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  45.05 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  37.91 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  46.67 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  34.25 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  34.25 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  38.89 
 
 		 195 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  42.45 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  35.17 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  40.52 
 
 		 183 aa  84.7  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  47.19 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  43.3 
 
 		 153 aa  84.3  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  36.88 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  46.51 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  51.16 
 
 		 130 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  41.84 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  39.53 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  44.79 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0926  transcription antitermination protein NusB  34.69 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  42.35 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  35.21 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  50 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  34.69 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1002  NusB antitermination factor  34.78 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  34.53 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  40.5 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2438  NusB antitermination factor  36.49 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1563  NusB antitermination factor  32.47 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01422  transcription antitermination protein NusB  36.13 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0163631  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  35.21 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  35.21 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  40.45 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  40.21 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  43.02 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  32.26 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  37.88 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  32.17 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  32.62 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  32.62 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  32.62 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  38 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>