More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0880 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  100 
 
 		 137 aa  270  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  79.26 
 
 		 142 aa  213  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  59.85 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  54.48 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  55.3 
 
 		 136 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  55.3 
 
 		 136 aa  147  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  51.13 
 
 		 135 aa  146  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  52.63 
 
 		 144 aa  146  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  52.59 
 
 		 137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  53.79 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  57.94 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  54.07 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  53.33 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  54.33 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  53.68 
 
 		 138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  48.95 
 
 		 145 aa  133  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  49.19 
 
 		 136 aa  130  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  48.51 
 
 		 135 aa  130  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  44.36 
 
 		 145 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  48.15 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  47.37 
 
 		 136 aa  120  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  45.8 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  45.8 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  45.8 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  53.98 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  46.92 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  48.82 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  43.94 
 
 		 164 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  43.94 
 
 		 190 aa  116  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  44.36 
 
 		 165 aa  115  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  45.11 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  43.94 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  43.51 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  43.94 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  45.54 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  42.64 
 
 		 139 aa  98.2  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  42.19 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  36.43 
 
 		 165 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  44.36 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  39.85 
 
 		 163 aa  92.8  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  34.38 
 
 		 167 aa  90.9  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  38.71 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14710  transcription antitermination factor NusB  40.44 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655877  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  35.94 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  39.1 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  37.5 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  34.06 
 
 		 163 aa  87.8  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  38.17 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  34.38 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  39.39 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  33.59 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  38.1 
 
 		 195 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  32.56 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  38.1 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  36.29 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  35.88 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  35.88 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  35.88 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  34.62 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  38.89 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  31.11 
 
 		 171 aa  84.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  34.85 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  34.88 
 
 		 168 aa  84  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  37.21 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  38.21 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  33.58 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  36.29 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  36.29 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  36.29 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  36.29 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  36.29 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  36.29 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  36.29 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  36.29 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  35.48 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  31.16 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  34.68 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  35.11 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  36.64 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  35.88 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  37.1 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  32.31 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  32.28 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  37.9 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  36.72 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  32.37 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  31.78 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  31.58 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  31.58 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  31.62 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  39.42 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  33.59 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  32.59 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  33.86 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  41.67 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  30.83 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  33.87 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  31.58 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  27.82 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  32.54 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>