More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1001 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  100 
 
 		 134 aa  268  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  44.09 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  48.84 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  44.83 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  45.35 
 
 		 138 aa  94  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  43.53 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  41.96 
 
 		 142 aa  90.5  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  37.74 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  36.57 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  38.4 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  43.01 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  43.62 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  41.07 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  43.18 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  35.54 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  35.54 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  41.86 
 
 		 153 aa  87.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  42.55 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  44.19 
 
 		 138 aa  87.4  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  38.71 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  39.33 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  50 
 
 		 183 aa  86.7  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  41.05 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  32.31 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  41.38 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  41.18 
 
 		 136 aa  84.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  41.18 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  40.91 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  30.47 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  37.21 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  41.18 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  41.18 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  40.91 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  45.24 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  38.89 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  41.38 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  41.18 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  41.18 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  40.91 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  35.24 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  39.08 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  44.83 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  38.64 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  35.71 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  41.18 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  39.56 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  41.3 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  32.73 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  40.48 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  36.67 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  41.46 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  43.18 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  44.19 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  45.12 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  43.68 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4049  NusB antitermination factor  38.14 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  38.64 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1027  transcription antitermination protein NusB  35.77 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  30.65 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  43.21 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  38.14 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  39.77 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  41.86 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  40 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  30 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3283  transcription antitermination protein NusB  35.77 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  42.68 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  40.7 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  36.78 
 
 		 156 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  39.74 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  33.64 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  40 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  36.59 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  37.21 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  35.34 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  35 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  34.44 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  35.42 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  36.08 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  37.89 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  37.89 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  37.89 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  38.37 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1166  transcription antitermination protein NusB  33.6 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000379162  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  39.08 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1074  transcription antitermination protein NusB  35.71 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547473  hitchhiker  0.000302454 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0803  NusB antitermination factor  36.84 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  37.65 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>