More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0751 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  100 
 
 		 146 aa  296  8e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  60.28 
 
 		 150 aa  166  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  60.29 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  60.29 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  41.09 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  41.09 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  40.31 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  38.52 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  38.93 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  39.55 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  39.55 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  34.11 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  38.58 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  39.55 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  38.26 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  38.97 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  35.42 
 
 		 138 aa  87.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  33.85 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  37.59 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  34.33 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  40.3 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  39.33 
 
 		 183 aa  85.5  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  34.75 
 
 		 138 aa  84.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  36.15 
 
 		 140 aa  84.7  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  41.79 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  33.81 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  38 
 
 		 167 aa  84.3  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  38.81 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  30.77 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  36.99 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  35.61 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  36.43 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  33.33 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  33.1 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  31.91 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0107  transcription antitermination protein NusB  29.17 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2438  NusB antitermination factor  33.09 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  43.82 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  33.8 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  33.09 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  37.69 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  36.76 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  36.17 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  38.89 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  33.11 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  33.1 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  34.11 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  39.1 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  31.65 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  29.77 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  35.66 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  33.79 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  30 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  40.62 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  32.39 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  36.76 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  33.83 
 
 		 165 aa  76.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  33.81 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  36.36 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  31.11 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  36.96 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  29.01 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  30.99 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  31.65 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  31.78 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  30.08 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  35.07 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0694  N utilization substance protein B  31.78 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4458  transcription antitermination protein NusB  32.56 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  34.38 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0803  NusB antitermination factor  31.33 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0698  NusB antitermination factor  32.85 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  31.82 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  34.33 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  36.57 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  32.39 
 
 		 162 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  32.39 
 
 		 162 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  35.51 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  32.39 
 
 		 162 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1444  NusB antitermination factor  35.94 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  29.23 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  36.3 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  41.57 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  34.62 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  34.33 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  32.56 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  34.33 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>