More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0030 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 131 aa  264  4e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  63.85 
 
 		 131 aa  170  7.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  59.54 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0541  transcription antitermination protein NusB  57.36 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  58.78 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  58.02 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1180  transcription antitermination protein NusB  62.2 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  53.85 
 
 		 136 aa  149  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  50 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0784  transcription antitermination protein NusB  52.76 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  32.56 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  29.69 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  29.46 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  34.33 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  35.16 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  35.82 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  30.23 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  34.33 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  32.33 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  32.58 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  30.77 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  30.83 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  34.29 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  28.79 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  31.25 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  31.54 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  31.54 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  27.82 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  30.77 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  31.54 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  32.56 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  33.08 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  35.38 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  31.78 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  32.54 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  31.54 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  35.29 
 
 		 195 aa  73.9  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  29.2 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  30.6 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  30 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  32.11 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  33.83 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  31.06 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  30.3 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  31.58 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3088  transcription antitermination protein NusB  35.83 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  33.86 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  31.78 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  32.56 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  31.54 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  31.54 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2897  transcription antitermination protein NusB  35.83 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  32.12 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  34.85 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1074  transcription antitermination protein NusB  34.17 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547473  hitchhiker  0.000302454 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1100  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000596608  normal  0.728168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1166  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00313304  normal  0.241653 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  30.16 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  41.57 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1100  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000020777  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  31.75 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  31.75 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  27.82 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  27.82 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  27.82 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  37.01 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  30 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  29.85 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  26.52 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1680  NusB antitermination factor  35.66 
 
 		 187 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.429573  normal  0.936323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  28.36 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0603  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.016248  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  31.75 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1563  NusB antitermination factor  31.01 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  32.31 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0477  NusB antitermination factor  32.35 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.144816  hitchhiker  0.000124521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  28.57 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  27.07 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  28.23 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3283  transcription antitermination protein NusB  34.19 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  32.81 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0584  transcription antitermination protein NusB  32.8 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  30.95 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  33.85 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  30.77 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0301  transcription antitermination factor NusB  32.35 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  30.58 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  30.3 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  30 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0803  NusB antitermination factor  31.25 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  27.07 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>