More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0164 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  100 
 
 		 165 aa  341  2.9999999999999997e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  40.31 
 
 		 143 aa  103  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  37.58 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  37.58 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  38.76 
 
 		 143 aa  101  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  37.98 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  38.46 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  34.25 
 
 		 145 aa  97.4  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  41.13 
 
 		 195 aa  97.1  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  36.69 
 
 		 143 aa  97.1  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  38.57 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  41.98 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  36.72 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  41.79 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  41.98 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  41.98 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  43.51 
 
 		 143 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1563  NusB antitermination factor  37.59 
 
 		 149 aa  95.5  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  37.21 
 
 		 145 aa  94.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0603  transcription antitermination protein NusB  34.29 
 
 		 139 aa  94.7  5e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.016248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  37.4 
 
 		 138 aa  94.4  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 135 aa  94.4  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  38.3 
 
 		 143 aa  94  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 		 130 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1532  transcription termination/antitermination factor NusB  34.27 
 
 		 138 aa  93.6  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.318402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0803  NusB antitermination factor  42.42 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1315  transcription antitermination protein NusB  34.27 
 
 		 140 aa  93.6  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  39.68 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  36.03 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  36.43 
 
 		 130 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 		 130 aa  92  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  36.43 
 
 		 130 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  39.37 
 
 		 138 aa  91.7  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  34.75 
 
 		 153 aa  91.3  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  34.51 
 
 		 165 aa  91.3  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2192  NusB antitermination factor  39.42 
 
 		 145 aa  90.5  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.133717  hitchhiker  0.00000478528 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  33.82 
 
 		 142 aa  90.5  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  35.77 
 
 		 183 aa  90.1  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0012  NusB antitermination factor  38 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3454  transcription antitermination protein NusB  33.79 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262306 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2897  transcription antitermination protein NusB  38.1 
 
 		 139 aa  89.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3283  transcription antitermination protein NusB  37.23 
 
 		 139 aa  89  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  33.8 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  33.09 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  34.38 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01422  transcription antitermination protein NusB  33.57 
 
 		 140 aa  88.6  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0163631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  36.23 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1680  NusB antitermination factor  34.78 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.429573  normal  0.936323 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  33.09 
 
 		 164 aa  88.2  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  35.07 
 
 		 167 aa  87.8  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3088  transcription antitermination protein NusB  36.76 
 
 		 139 aa  87.8  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  35.88 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  35.88 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  35.88 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  35.88 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  35.88 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1027  transcription antitermination protein NusB  36.5 
 
 		 139 aa  87.4  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 165 aa  87  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 134 aa  87  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  35.66 
 
 		 130 aa  87  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  34.35 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  35.88 
 
 		 134 aa  86.3  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  34.35 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  38.1 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1444  NusB antitermination factor  34.62 
 
 		 145 aa  86.3  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00364  transcription antitermination protein NusB  34.56 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.997296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3193  NusB antitermination factor  34.56 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3115  transcription antitermination protein NusB  35.04 
 
 		 138 aa  85.5  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0337  transcription antitermination protein NusB  34.56 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.570636  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3256  transcription antitermination protein NusB  35.04 
 
 		 138 aa  85.5  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05376  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3165  transcription antitermination protein NusB  35.04 
 
 		 138 aa  85.5  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0452  transcription antitermination protein NusB  34.56 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0447  transcription antitermination protein NusB  34.56 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  32.82 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00368  hypothetical protein  34.56 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3217  transcription antitermination protein NusB  34.56 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0498  transcription antitermination protein NusB  34.56 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0487  transcription antitermination protein NusB  34.56 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  32.37 
 
 		 171 aa  85.1  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1396  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 134 aa  85.1  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  32.82 
 
 		 142 aa  84.7  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1074  transcription antitermination protein NusB  34.78 
 
 		 138 aa  84.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547473  hitchhiker  0.000302454 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1865  NusB antitermination factor  37.31 
 
 		 196 aa  84.7  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1166  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 135 aa  84.7  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000379162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1100  transcription antitermination protein NusB  35.11 
 
 		 134 aa  84.7  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000596608  normal  0.728168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1166  transcription antitermination protein NusB  35.11 
 
 		 134 aa  84.7  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00313304  normal  0.241653 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  32.52 
 
 		 141 aa  84.3  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01170  transcription antitermination protein NusB  33.99 
 
 		 155 aa  84.3  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1100  transcription antitermination protein NusB  35.11 
 
 		 134 aa  84.7  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000020777  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  39.69 
 
 		 145 aa  84  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0520  transcription antitermination protein NusB  33.82 
 
 		 139 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>