More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2598 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  100 
 
 		 156 aa  316  7e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  50.37 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  50.37 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  48.51 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  49.22 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  47.66 
 
 		 133 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  46.76 
 
 		 148 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  46.4 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  43.85 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  41.86 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  35.94 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  37.41 
 
 		 183 aa  104  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  103  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  40 
 
 		 195 aa  100  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  39.26 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  37.68 
 
 		 142 aa  100  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  34.85 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  34.06 
 
 		 145 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  38.76 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  37.59 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  39.26 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  38.69 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  39.71 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  36.22 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  41.54 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  36.96 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  42.96 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  40.44 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  43.08 
 
 		 165 aa  96.3  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  31.5 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  31.5 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  40.62 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  40.62 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  32.56 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  33.83 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  40.62 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  30.71 
 
 		 143 aa  95.5  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  35.88 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  34.85 
 
 		 138 aa  94.4  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  37.8 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  36.64 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  34.85 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  37.5 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2438  NusB antitermination factor  33.57 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  40.46 
 
 		 169 aa  90.9  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  36.92 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  34.62 
 
 		 136 aa  90.9  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  35.25 
 
 		 140 aa  90.5  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  37.8 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  39.85 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  31.82 
 
 		 138 aa  90.1  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  36.72 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  35.38 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  40.62 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  31.82 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  34.38 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  36.64 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  37.4 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  34.35 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  33.6 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  35.61 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  30.3 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  35.56 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  34.35 
 
 		 166 aa  87.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  36.17 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 136 aa  87.4  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  33.85 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  39.84 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  36.15 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  32.09 
 
 		 139 aa  86.3  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  34.33 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  31.5 
 
 		 138 aa  85.5  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  37.59 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  33.33 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  39.55 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  35.88 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  34.11 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  31.03 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  31.5 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 162 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  28.85 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 162 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 162 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  33.86 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  34.97 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  36.96 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  32.06 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  35.61 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  28.68 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>