More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1279 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  100 
 
 		 155 aa  307  4e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  50.37 
 
 		 156 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  51.15 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  53.68 
 
 		 138 aa  137  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  50.35 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  45.38 
 
 		 145 aa  125  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  47.45 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  44.36 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  48.82 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  45.31 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  43.61 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  43.61 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  46.97 
 
 		 138 aa  117  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  43.61 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  43.61 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  43.61 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  43.61 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  43.61 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  43.61 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  43.61 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  46.97 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  50.38 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  48.46 
 
 		 142 aa  114  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  42.86 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  43.28 
 
 		 133 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  48.09 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  48.09 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  48.09 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  44.12 
 
 		 145 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  40.77 
 
 		 153 aa  111  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  43.94 
 
 		 151 aa  110  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  40.15 
 
 		 143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  40.15 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  37.69 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  40.15 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  47.62 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  46.21 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  42.31 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  41.79 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  42.19 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  39.55 
 
 		 154 aa  104  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  45.31 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  40.74 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  39.29 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  45.38 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  45.11 
 
 		 195 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  42.03 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  38.97 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  38.57 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  40 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  36.09 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  44.96 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  40.91 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  45.59 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  40.58 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  39.53 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  43.06 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  43.94 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  39.01 
 
 		 183 aa  97.8  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  44.53 
 
 		 162 aa  97.8  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  46.27 
 
 		 166 aa  97.4  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  44.19 
 
 		 142 aa  97.4  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  37.21 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  36.3 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  43.94 
 
 		 136 aa  97.1  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  38.57 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  38.35 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  38.41 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  37.23 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  35.38 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  38.89 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  42.22 
 
 		 165 aa  94.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  41.4 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  34.72 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  34.33 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  37.12 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  42.99 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  39.85 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  36.17 
 
 		 190 aa  90.9  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  37.98 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  45.45 
 
 		 138 aa  91.3  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  38.33 
 
 		 136 aa  90.5  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  39.69 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  31.34 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  31.34 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  37.23 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  34.11 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  38.71 
 
 		 445 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  37.96 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  36.64 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  39.37 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  42.86 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  38.17 
 
 		 449 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  38.58 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  35.29 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  53.42 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>