More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2372 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  100 
 
 		 152 aa  306  6.999999999999999e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2438  NusB antitermination factor  72.73 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0698  NusB antitermination factor  53.57 
 
 		 169 aa  144  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  36.96 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  36.62 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  36.96 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  36.96 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  39.71 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  32.88 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  43.69 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  36.3 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  36.3 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  36.3 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  30.94 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  31.58 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  34.06 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  34.81 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  31.58 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  37.23 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  50 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  32.87 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  36.76 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  35.21 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  33.58 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  36.62 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  33.11 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  34.07 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  32.85 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  33.58 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  30.37 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  30.83 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  32.84 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  31.82 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  30.88 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  29.66 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  29.71 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  36.69 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  32.61 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  31.88 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  33.82 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  28.99 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  35.21 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  36.03 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  29.93 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  31.88 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  29.93 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  46.99 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0694  N utilization substance protein B  32.43 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4458  transcription antitermination protein NusB  32.43 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1471  NusB antitermination factor  28.57 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  31.88 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  39.33 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  31.97 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  34.78 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  31.88 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  30.22 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  32.17 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  28.26 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  42.17 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  32.17 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  31.13 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  31.88 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  34.53 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  35.04 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0107  transcription antitermination protein NusB  28.57 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  42.25 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  36.67 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  35.56 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  36.67 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  41.86 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  30.94 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  40.2 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  35.25 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  34.78 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  29.08 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  38.89 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3454  transcription antitermination protein NusB  31.13 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  30.99 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1752  NusB antitermination factor  26.47 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1049  transcription antitermination protein NusB  31.03 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  35.29 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  33.09 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11450  transcription antitermination protein NusB  31.03 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0546593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  30.83 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  30.82 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  30.07 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2582  NusB antitermination factor  28.85 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  36.56 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>