280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1752 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1752  NusB antitermination factor  100 
 
 		 130 aa  256  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1471  NusB antitermination factor  49.61 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  36.51 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  32.03 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  30.37 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  32.82 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  30.37 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  30.37 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  31.82 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  31.62 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  31.06 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  32.03 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  30.23 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  30.23 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  29.46 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  32.58 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  30.47 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  25.2 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  31.3 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  33.07 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  35.2 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  32.06 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  35.2 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  31.2 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  26.02 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  29.77 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  30.77 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  31.71 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  35.63 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  30.16 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  32.84 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  31.58 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  30 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  30.6 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  23.44 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  23.44 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  23.44 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  31.01 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  32.28 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  30 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  30.4 
 
 		 165 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  32.28 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  31.5 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  30.71 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  30.71 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  26.47 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  29.23 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  29.01 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  29.23 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  28.89 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  30.77 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  30.53 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0784  transcription antitermination protein NusB  33.06 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  28.57 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  28.8 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  29.27 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  26.56 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  29.23 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  29.23 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  29.23 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  29.23 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  29.23 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  30.53 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  29.23 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  31.25 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  29.23 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3454  transcription antitermination protein NusB  30.4 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  29.23 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2438  NusB antitermination factor  26.43 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0603  transcription antitermination protein NusB  30.4 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.016248  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1315  transcription antitermination protein NusB  30.4 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  29.37 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0541  transcription antitermination protein NusB  31.71 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  30.37 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  32.93 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  28.8 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  28 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2897  transcription antitermination protein NusB  32.5 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3283  transcription antitermination protein NusB  30.43 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  29.27 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1180  transcription antitermination protein NusB  31.75 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  28.68 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  30.47 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  33.65 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  27.2 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  28 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  35.56 
 
 		 325 aa  60.8  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  29.85 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  29.01 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  32.18 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3256  transcription antitermination protein NusB  31.03 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05376  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3115  transcription antitermination protein NusB  31.03 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3165  transcription antitermination protein NusB  31.03 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0698  NusB antitermination factor  26.32 
 
 		 169 aa  60.1  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1027  transcription antitermination protein NusB  29.57 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  28.57 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  26.52 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1166  transcription antitermination protein NusB  30.23 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000379162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  29.01 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  27.56 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>