268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1471 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1471  NusB antitermination factor  100 
 
 		 133 aa  259  6e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1752  NusB antitermination factor  49.61 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  35.66 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  28.57 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  32.82 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  32.82 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  32.56 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2438  NusB antitermination factor  30.56 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  32.56 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  32.82 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  32.82 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  32.82 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  32.82 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  32.82 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  32.82 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  32.82 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  32.82 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  31.3 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  31.71 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  34.09 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0784  transcription antitermination protein NusB  30 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  28.57 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  27.07 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  30.66 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  33.58 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  30 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  28 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  32.81 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  31.39 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  46.03 
 
 		 325 aa  67  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  32.03 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  28.79 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  31.85 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  31.39 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0541  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  29.37 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  27.69 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  28.57 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1180  transcription antitermination protein NusB  33.07 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  28.79 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  32.33 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  32.59 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  31.06 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  36.26 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  28.79 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  35.11 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  27.82 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  30.08 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  27.69 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  29.13 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  28.87 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  26.77 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  28.68 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  36.76 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  27.34 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  29.46 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0698  NusB antitermination factor  24.66 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  26.52 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  28.89 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1038  NusB antitermination factor  31.19 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000780031  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  28.18 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6247  NusB antitermination factor  30.61 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  30.77 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  27.78 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  36.14 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  27.86 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  34.26 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  28.68 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2447  antitermination factor  40.28 
 
 		 389 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351781  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  26.28 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  32.93 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1966  N utilization substance protein B  32.61 
 
 		 302 aa  58.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0692003  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  26.74 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  32.26 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  39.44 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  31.85 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  32.93 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  32.93 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2471  transcription antitermination protein NusB  35.56 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.526539  hitchhiker  0.00000000554853 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2202  transcription termination factor-like protein  32.61 
 
 		 303 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  34.09 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  27.52 
 
 		 165 aa  57  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  27.41 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  26.12 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  31.96 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  31.58 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  27.07 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  28.46 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  35 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  36.49 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  30.08 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6330  NusB antitermination factor  34.12 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  27.07 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  26.87 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  36.76 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0422  hypothetical protein  29.91 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>