More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1180 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1180  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0784  transcription antitermination protein NusB  69.47 
 
 		 131 aa  186  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  62.2 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  60.16 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  59.06 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  59.06 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  58.27 
 
 		 132 aa  150  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0541  transcription antitermination protein NusB  54.96 
 
 		 132 aa  143  8.000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  51.16 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  50 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  38.1 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  38.1 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  38.1 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  38.1 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  38.1 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  38.89 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  37.3 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1100  transcription antitermination protein NusB  37.3 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000596608  normal  0.728168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1166  transcription antitermination protein NusB  37.3 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00313304  normal  0.241653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1100  transcription antitermination protein NusB  37.3 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000020777  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  32.82 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  34.13 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  32.35 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1166  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000379162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  37.69 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0603  transcription antitermination protein NusB  33.86 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.016248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4458  transcription antitermination protein NusB  37.5 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3853  transcription antitermination protein NusB  35.88 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  34.92 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1074  transcription antitermination protein NusB  33.61 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547473  hitchhiker  0.000302454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0694  N utilization substance protein B  36.72 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  44.05 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  34.38 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0926  transcription antitermination protein NusB  34.29 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00364  transcription antitermination protein NusB  34.45 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.997296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3193  NusB antitermination factor  34.45 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0337  transcription antitermination protein NusB  34.45 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.570636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3217  transcription antitermination protein NusB  34.45 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0487  transcription antitermination protein NusB  34.45 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0498  transcription antitermination protein NusB  34.45 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  44.58 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00368  hypothetical protein  34.45 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0447  transcription antitermination protein NusB  34.45 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0452  transcription antitermination protein NusB  34.45 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11450  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0546593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  31.06 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1049  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0520  transcription antitermination protein NusB  33.61 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0478  transcription antitermination protein NusB  33.61 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0459  transcription antitermination protein NusB  33.61 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0457  transcription antitermination protein NusB  33.61 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.478814  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0465  transcription antitermination protein NusB  33.61 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2897  transcription antitermination protein NusB  35.29 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004261  transcription termination protein NusB  32.86 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00012061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1315  transcription antitermination protein NusB  34.92 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1532  transcription termination/antitermination factor NusB  33.08 
 
 		 138 aa  67  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.318402  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  30.95 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1027  transcription antitermination protein NusB  34.45 
 
 		 139 aa  67  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3283  transcription antitermination protein NusB  33.61 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0884  transcription antitermination protein NusB  33.61 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0803  NusB antitermination factor  34.68 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  36.22 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  31.82 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  48.65 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3088  transcription antitermination protein NusB  36.13 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3165  transcription antitermination protein NusB  31.93 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  40.96 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01170  transcription antitermination protein NusB  32.14 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3115  transcription antitermination protein NusB  31.93 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3454  transcription antitermination protein NusB  34.92 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262306 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3256  transcription antitermination protein NusB  31.93 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05376  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1444  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  31.06 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  32.52 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  29.77 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5015  transcription antitermination protein NusB  34.85 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  32.84 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0831  transcription antitermination protein NusB  35.29 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000197838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0584  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  43.94 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  47.3 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  47.89 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  47.89 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  47.89 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  44.29 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1396  NusB antitermination factor  31.5 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  47.89 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  47.89 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  47.89 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0737  transcription antitermination protein NusB  42.5 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  44.29 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  47.3 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0846  NusB antitermination factor  31.75 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.423141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  47.89 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  29.55 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06760  transcription antitermination protein NusB  34.17 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0107  transcription antitermination protein NusB  32.61 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2768  NusB antitermination factor  32.33 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520955  normal  0.497476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>