More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12553 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 156 aa  304  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  77.56 
 
 		 162 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  77.56 
 
 		 162 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  77.56 
 
 		 162 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  79.49 
 
 		 163 aa  243  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  79.22 
 
 		 164 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  53.38 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  53.62 
 
 		 139 aa  147  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  54.01 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  52.11 
 
 		 144 aa  136  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  51.45 
 
 		 138 aa  135  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  50.36 
 
 		 142 aa  133  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  51.08 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  48.55 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  50 
 
 		 135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  50.74 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  47.86 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  53.79 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  46.53 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  46.15 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  49.26 
 
 		 136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  51.43 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  46.38 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  45.99 
 
 		 138 aa  122  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  43.88 
 
 		 138 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  47.06 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  45.04 
 
 		 137 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  43.41 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  43.41 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  44.2 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  45.9 
 
 		 137 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  45.04 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  43.85 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  42.31 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  40.77 
 
 		 190 aa  98.2  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  38.93 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  40.91 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  37.98 
 
 		 183 aa  95.1  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  52.22 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  40.31 
 
 		 133 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  40.31 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  34.33 
 
 		 138 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  46.79 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  33.83 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  33.58 
 
 		 138 aa  90.5  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  37.4 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  36.43 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  45.57 
 
 		 142 aa  87.4  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  31.06 
 
 		 141 aa  87.4  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  36.92 
 
 		 195 aa  87  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  32.06 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  34.62 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  32.03 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  34.11 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  35.16 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  33.83 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  33.85 
 
 		 129 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  44.3 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  33.85 
 
 		 129 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  39.37 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  34.13 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  30.23 
 
 		 130 aa  85.1  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  34.11 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  33.83 
 
 		 145 aa  84.7  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 135 aa  84.3  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  32.56 
 
 		 142 aa  84.3  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  32.58 
 
 		 143 aa  84.3  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  34.88 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  34.35 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  32.82 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  29.46 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  38.06 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  29.46 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  29.46 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  29.46 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  29.46 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  29.46 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  29.46 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  29.46 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  30.37 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  29.45 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  35.34 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  29.46 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  34.88 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14710  transcription antitermination factor NusB  35.82 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655877  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0698  NusB antitermination factor  36.69 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  29.63 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  35.61 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  30.23 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  30.77 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  35.11 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  34.13 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  37.4 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  37.4 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  37.4 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  34.09 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  30 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  32.59 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>