More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1693 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 144 aa  290  4e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  65.73 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  44.27 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  41.73 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  42.75 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  41.98 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  41.98 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  41.98 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  41.98 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  41.98 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  41.98 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  41.98 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  41.98 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  41.98 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  43.64 
 
 		 325 aa  99  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  40.46 
 
 		 133 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  42.96 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  39.53 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  36.57 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  36.57 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  36.57 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  42.75 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  39.69 
 
 		 130 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  37.06 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  35.07 
 
 		 138 aa  91.3  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  38.57 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  36.84 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  36.23 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  35.56 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  37.59 
 
 		 165 aa  88.2  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  34.81 
 
 		 163 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  35.51 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  35.29 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  40.29 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  36.36 
 
 		 139 aa  86.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  35.62 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  34.29 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  35.82 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  36.57 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  34.81 
 
 		 144 aa  85.5  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  34.85 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  29.2 
 
 		 190 aa  84  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  36.09 
 
 		 165 aa  84  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  35.34 
 
 		 164 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  36.36 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  35.71 
 
 		 141 aa  83.6  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  40.77 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  33.83 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  40.77 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  34.56 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  32.33 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  36.76 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  32.35 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  36.36 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  35.61 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  41.67 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  34.09 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  33.58 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  39.6 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0422  hypothetical protein  44.3 
 
 		 378 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  36.09 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  35.42 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  38.71 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  38.53 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  37.04 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  33.85 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  33.85 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  36.09 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  34.62 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  34.62 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  37.3 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  35 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  34.62 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  35.29 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  34.31 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  32.59 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  35 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  36.56 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  28.26 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  34.09 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  46.25 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  34.35 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  39.56 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  33.79 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  34.74 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  32.59 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  35.82 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  36.36 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  31.62 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  31.88 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  39.53 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  38.14 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  34.51 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  39.08 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1238  transcription termination factor  31.34 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>