More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1703 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  100 
 
 		 135 aa  267  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  70.54 
 
 		 135 aa  158  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  55.46 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  55.36 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  52.68 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  53.77 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  52.68 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  53.21 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  51.79 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  53.21 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  57.45 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  50.51 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  57.78 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  52.58 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  46.49 
 
 		 150 aa  104  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  55.06 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  52.69 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  45.54 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  53.47 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  48.62 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  47.32 
 
 		 136 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  58.14 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  48.36 
 
 		 163 aa  100  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  49.52 
 
 		 136 aa  99.4  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  49.46 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  47.62 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  47.12 
 
 		 190 aa  98.2  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  48.18 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  48.48 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  52 
 
 		 165 aa  95.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  48.6 
 
 		 156 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  52.75 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  40.37 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  52.22 
 
 		 162 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  52.22 
 
 		 162 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  52.22 
 
 		 162 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  48.91 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  42.71 
 
 		 160 aa  90.9  6e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  47.56 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  41.67 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  48.54 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  46.94 
 
 		 195 aa  89.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  47.83 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  45.45 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  44.9 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  45.56 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  39.39 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  44.33 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  44.57 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  46.34 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  39.45 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  43.88 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  46.34 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  38.95 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  44.19 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  46.51 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  47.67 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  37.86 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  37.76 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  38.3 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  50.59 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  50.59 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  50.59 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  36 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  44.58 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  43.37 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  35.71 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  45.26 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  52.56 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  40.66 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  36.19 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  42.59 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  40.91 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  36.11 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  41.28 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  43.18 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  40.7 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  38.2 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  41.67 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  50 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  40 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  38.64 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  40.86 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  37.5 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  37.8 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  45.98 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  41.84 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  39.02 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  40.54 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  37.93 
 
 		 164 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  33.68 
 
 		 325 aa  73.6  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  40.23 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  38.82 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  35.51 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3073  NusB antitermination factor  44.21 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  44.71 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  38.46 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>