More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1713 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 144 aa  289  8e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  65.73 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  44.7 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  39.31 
 
 		 137 aa  97.4  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  45.93 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  42.75 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  42.75 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  43.51 
 
 		 130 aa  93.6  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  42.75 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  42.75 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  42.75 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  42.75 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  42.75 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  42.75 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  42.75 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  41.98 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  41.22 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  41.98 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  35.11 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  36.3 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  38.41 
 
 		 145 aa  84.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  38.18 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  36.69 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  37.5 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  35.04 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  36.09 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  36.81 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  34.33 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  35.88 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  35.88 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1238  transcription termination factor  33.58 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  36.76 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  35.34 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0107  transcription antitermination protein NusB  36.76 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  37.78 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  35.38 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  34.09 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  35.38 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  33.83 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  33.59 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  35.77 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  35.46 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  34.97 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  33.58 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  34.11 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  34.62 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  34.81 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  34.62 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  35.88 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  34.62 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  33.85 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  34.59 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  33.85 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  29.41 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  37.29 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2676  transcription antitermination protein NusB  31.65 
 
 		 174 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0143299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  43.01 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  32.37 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  37.29 
 
 		 235 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.705133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  34.81 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  31.65 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  34.85 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  33.08 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  33.58 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  33.58 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0422  hypothetical protein  41.67 
 
 		 378 aa  73.9  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  33.58 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  35.34 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  39.39 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  36.67 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  32.35 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0634  transcription antitermination protein NusB  33.1 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0820707  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  32.84 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  34.81 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  34.27 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  35.07 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2639  transcription antitermination protein NusB  30.43 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.093311  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  34.72 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  39.56 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  31.85 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  34.78 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1819  transcription antitermination protein NusB  31.94 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  34.09 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  35.11 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  35.56 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  34.81 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  29.85 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  32.37 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  35.56 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  31.47 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0763  transcription antitermination protein NusB  31.3 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1280  transcription antitermination protein NusB  32.61 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1722  transcription antitermination protein NusB  31.01 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.0484184 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2525  transcription antitermination protein NusB  31.3 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>