More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1238 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1238  transcription termination factor  100 
 
 		 130 aa  264  4e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  39.84 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  33.58 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  33.87 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  34.62 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1315  transcription antitermination protein NusB  35.2 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  34.68 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  35.66 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  31.34 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  29.77 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  35.16 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  39.06 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  30.99 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  34.59 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0520  transcription antitermination protein NusB  36.97 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0465  transcription antitermination protein NusB  36.97 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0457  transcription antitermination protein NusB  36.97 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.478814  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  29.92 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  32.58 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0478  transcription antitermination protein NusB  36.97 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0459  transcription antitermination protein NusB  36.97 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  31.2 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  32.03 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1166  transcription antitermination protein NusB  32.56 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000379162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  33.85 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0603  transcription antitermination protein NusB  32.8 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.016248  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1396  NusB antitermination factor  30.65 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0884  transcription antitermination protein NusB  36.97 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1444  NusB antitermination factor  36.29 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  37.5 
 
 		 325 aa  70.5  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0750  transcription termination factor  30.77 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.906803  hitchhiker  0.00118755 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00364  transcription antitermination protein NusB  36.13 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.997296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3193  NusB antitermination factor  36.13 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0498  transcription antitermination protein NusB  36.13 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00368  hypothetical protein  36.13 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0452  transcription antitermination protein NusB  36.13 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3217  transcription antitermination protein NusB  36.13 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0447  transcription antitermination protein NusB  36.13 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0487  transcription antitermination protein NusB  36.13 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  30.3 
 
 		 166 aa  70.1  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0337  transcription antitermination protein NusB  36.13 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.570636  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  33.59 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  31.78 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  32.35 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  29.13 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  29.13 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  34.62 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  31.78 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01170  transcription antitermination protein NusB  30 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3256  transcription antitermination protein NusB  35.29 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  31.25 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  31.25 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3115  transcription antitermination protein NusB  35.29 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  31.25 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  33.58 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  31.25 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  33.58 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  37.36 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  31.25 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  33.58 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  31.25 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3165  transcription antitermination protein NusB  35.29 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  29.13 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  33.86 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0803  NusB antitermination factor  33.86 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  29.77 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0584  transcription antitermination protein NusB  31.45 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  26.24 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  27.48 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  30.47 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1100  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000596608  normal  0.728168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1166  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00313304  normal  0.241653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1100  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000020777  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  29.13 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1027  transcription antitermination protein NusB  32.77 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  28.68 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004261  transcription termination protein NusB  29.29 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00012061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3283  transcription antitermination protein NusB  31.93 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3454  transcription antitermination protein NusB  28.91 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262306 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  30.71 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  27.91 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  32.56 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3088  transcription antitermination protein NusB  33.61 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01422  transcription antitermination protein NusB  34.65 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0163631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  29.77 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  32.8 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  28.26 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  29.58 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  28.91 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1563  NusB antitermination factor  33.85 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>