More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0750 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0750  transcription termination factor  100 
 
 		 133 aa  269  8.000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.906803  hitchhiker  0.00118755 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  36.64 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  36.36 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  43.01 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  36.84 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  37.3 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  31.45 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  31.45 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  35.07 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  31.58 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  34.26 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  31.06 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  31.06 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  31.06 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  31.06 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 163 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  37.35 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  35.38 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  30.47 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  35.38 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  29.2 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  37.35 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  29.27 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  35.77 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  28.68 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1238  transcription termination factor  30.77 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  38.55 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  38.37 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  37.08 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  33.58 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  31.58 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  32.84 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  30.83 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  32.61 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  29.55 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  33.07 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  31.91 
 
 		 135 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3454  transcription antitermination protein NusB  33.87 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  29.77 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  32.58 
 
 		 135 aa  66.6  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  31.01 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  31.09 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  28.79 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  27.61 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  35.2 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  28.57 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  37.93 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  31.5 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  32.18 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1444  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  36.05 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  32.95 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  31.36 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  33.71 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  30.53 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  34.07 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  34.78 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  29.13 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  33.71 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  36.05 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  28 
 
 		 183 aa  63.5  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  28.36 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  28.57 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  29.93 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  28.68 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  30.77 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  30.77 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  30.77 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  30.77 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  31.33 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  30.77 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  34.09 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0010  transcription antitermination protein NusB  33.73 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  28.12 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  34.09 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  30.47 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  27.64 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  29.85 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  33.09 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  33.09 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  27.61 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1166  transcription antitermination protein NusB  26.67 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000379162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  30.08 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1100  transcription antitermination protein NusB  29.85 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000596608  normal  0.728168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1166  transcription antitermination protein NusB  29.85 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00313304  normal  0.241653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1100  transcription antitermination protein NusB  29.85 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000020777  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  33.33 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  35.23 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  26.92 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  30.77 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  27.41 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>