More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1391 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  100 
 
 
144 aa  292  9e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  75.94 
 
 
136 aa  211  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  62.1 
 
 
136 aa  161  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  59.54 
 
 
136 aa  160  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  59.26 
 
 
138 aa  159  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  56.62 
 
 
142 aa  156  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  58.02 
 
 
136 aa  155  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  53.79 
 
 
135 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  54.55 
 
 
139 aa  150  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  53.68 
 
 
150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  56.12 
 
 
145 aa  150  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  55.56 
 
 
138 aa  147  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  56.3 
 
 
138 aa  147  7e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  54.14 
 
 
137 aa  146  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  55.3 
 
 
145 aa  146  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  55.88 
 
 
138 aa  144  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  54.14 
 
 
138 aa  143  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  51.45 
 
 
144 aa  140  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  53.49 
 
 
136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  53.49 
 
 
136 aa  135  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  52 
 
 
137 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  50.77 
 
 
153 aa  135  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  49.3 
 
 
164 aa  136  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  52.46 
 
 
135 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  54.14 
 
 
153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  50 
 
 
163 aa  133  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  52.21 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  52.21 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  52.21 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  50.74 
 
 
156 aa  130  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  55.36 
 
 
135 aa  124  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  56.76 
 
 
135 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  46.53 
 
 
165 aa  120  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  48.53 
 
 
163 aa  117  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  42.74 
 
 
160 aa  104  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  43.48 
 
 
147 aa  103  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  41.94 
 
 
190 aa  103  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  41.67 
 
 
195 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14710  transcription antitermination factor NusB  42.96 
 
 
178 aa  101  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655877  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  42.74 
 
 
167 aa  99.4  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  42.28 
 
 
145 aa  96.7  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  40.74 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  38.4 
 
 
140 aa  94  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  37.69 
 
 
140 aa  91.3  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  35.38 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 
133 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  41.09 
 
 
162 aa  89  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  33.6 
 
 
156 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  40.94 
 
 
130 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  36.72 
 
 
155 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  35.66 
 
 
154 aa  84.7  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  34.68 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  34.65 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  37.6 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  36.92 
 
 
138 aa  84  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  35.66 
 
 
151 aa  84  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  39.52 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  39.52 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  39.52 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  41.84 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  37.01 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  42.17 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  31.65 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  38.84 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  33.87 
 
 
138 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  38.35 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  35.38 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  35.42 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  39.2 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  35.11 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  33.08 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  37.59 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  33.07 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  33.07 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  32.28 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  33.07 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  33.07 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  33.07 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  33.07 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  33.07 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  38.14 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  33.07 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  33.06 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  30.08 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  33.59 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  33.83 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  32.58 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  33.06 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  32.03 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  33.58 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  36.79 
 
 
154 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  32.82 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0424  NusB antitermination factor  43.75 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.518961  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  32.26 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  34.65 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  32.12 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  32.8 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>