More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4034 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 130 aa  263  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  96.92 
 
 		 130 aa  253  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  96.92 
 
 		 130 aa  253  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  96.15 
 
 		 130 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  96.92 
 
 		 130 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  96.92 
 
 		 130 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  96.92 
 
 		 130 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  96.92 
 
 		 130 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  96.92 
 
 		 130 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  96.92 
 
 		 130 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  92.31 
 
 		 130 aa  241  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  52.31 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  50.77 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  46.56 
 
 		 143 aa  120  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  46.62 
 
 		 145 aa  116  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  42.86 
 
 		 155 aa  114  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  46.62 
 
 		 138 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  42.75 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  44.27 
 
 		 195 aa  104  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  38.28 
 
 		 183 aa  103  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  44.7 
 
 		 138 aa  103  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  44.44 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  44.19 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  41.09 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  43.28 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  41.54 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  40.91 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  41.98 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  40.58 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  40.58 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  40.16 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  42.45 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  41.3 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  41.04 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  41.04 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  39.37 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  37.88 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  38.93 
 
 		 168 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  39.53 
 
 		 138 aa  93.6  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  35.56 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  38.17 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  37.4 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  37.21 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  41.22 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  43.08 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  37.69 
 
 		 129 aa  90.1  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  40.15 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  37.01 
 
 		 162 aa  88.6  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  37.5 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  37.23 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  37.23 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  39.23 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  37.23 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  34.4 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  40.48 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  37.98 
 
 		 154 aa  88.2  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  37.98 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  34.11 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  34.11 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  34.11 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  37.88 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  35.66 
 
 		 165 aa  87  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  34.35 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  40.31 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  35.61 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  35.88 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  37.68 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  38.35 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0422  hypothetical protein  36.27 
 
 		 378 aa  85.9  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  36.8 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  34.59 
 
 		 190 aa  85.1  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  37.9 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  38.76 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  37.5 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  35.07 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1038  NusB antitermination factor  40.62 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000780031  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0584  transcription antitermination protein NusB  35.77 
 
 		 159 aa  84  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  36.09 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3103  transcription antitermination protein NusB  35.61 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  31.85 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0891  transcription antitermination protein NusB  35.61 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  33.85 
 
 		 163 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  37.21 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  38.89 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0477  NusB antitermination factor  37.4 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.144816  hitchhiker  0.000124521 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  35.94 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0301  transcription antitermination factor NusB  37.4 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  39.53 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0698  NusB antitermination factor  34.53 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  32.81 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  34.85 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  35.94 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  35.94 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  35.94 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  35.94 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  35.94 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>