More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0422 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0422  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  767    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4924  NusB antitermination factor  25.73 
 
 		 388 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6330  NusB antitermination factor  27.69 
 
 		 378 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2447  antitermination factor  25.07 
 
 		 389 aa  126  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351781  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1401  NusB/RsmB/TIM44  30.58 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979954 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1966  N utilization substance protein B  28.67 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0692003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6247  NusB antitermination factor  29.61 
 
 		 309 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  43.16 
 
 		 165 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12923  putative N utilization substance protein  26.87 
 
 		 302 aa  92  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  38.24 
 
 		 130 aa  88.6  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  42.24 
 
 		 165 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  36.27 
 
 		 130 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2202  transcription termination factor-like protein  27.96 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  36.27 
 
 		 130 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  43.27 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  36.27 
 
 		 130 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  36.27 
 
 		 130 aa  84  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  36.27 
 
 		 130 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  36.27 
 
 		 130 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  45.56 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  36.27 
 
 		 130 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  36.27 
 
 		 130 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  39.1 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  36.27 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  42.7 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  38 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  36.27 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  41.57 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  40.37 
 
 		 138 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  45.56 
 
 		 171 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  44.3 
 
 		 144 aa  81.3  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  34.71 
 
 		 141 aa  80.9  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  38.32 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  47.22 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  47.89 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  36.26 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  37.11 
 
 		 147 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  32.03 
 
 		 162 aa  75.1  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  34.96 
 
 		 142 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  28.7 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  42.05 
 
 		 140 aa  73.9  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  34.15 
 
 		 142 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  36.67 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  41.67 
 
 		 144 aa  73.9  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0807  NusB family protein  35.16 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  40.54 
 
 		 183 aa  72.4  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  32.99 
 
 		 155 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  34.07 
 
 		 144 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  35.11 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  33.03 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  34.92 
 
 		 144 aa  71.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  43.66 
 
 		 139 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  31.01 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  31.68 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  39.19 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  36.59 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  33.02 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  37.8 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  42.67 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  36.67 
 
 		 154 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  31.68 
 
 		 145 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  36.59 
 
 		 136 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  31.68 
 
 		 145 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  36 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  36 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  36 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0424  NusB antitermination factor  31.78 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.518961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  29 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  34.09 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  32.58 
 
 		 143 aa  67  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  38.03 
 
 		 163 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  28.57 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  30.91 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  32.97 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1589  NusB antitermination factor  35.23 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  32.58 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  37.35 
 
 		 154 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  39.51 
 
 		 129 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  37.18 
 
 		 143 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  39.76 
 
 		 129 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  34.15 
 
 		 135 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  40.3 
 
 		 153 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  35.48 
 
 		 154 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  39.76 
 
 		 129 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  35.37 
 
 		 136 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  32.26 
 
 		 151 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  36.11 
 
 		 164 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  34.57 
 
 		 138 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  36 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  41.43 
 
 		 138 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  29.41 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  40.79 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  37.35 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  31.21 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  32.18 
 
 		 142 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  32.18 
 
 		 142 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  36.9 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 147 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  32.18 
 
 		 142 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  37.8 
 
 		 137 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>