More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1792 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 135 aa  266  7e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  98.52 
 
 		 135 aa  264  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  45.11 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  44.7 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  36.15 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  42.54 
 
 		 130 aa  100  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  42.54 
 
 		 130 aa  100  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  41.67 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  42.54 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  42.54 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  42.54 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  42.54 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  37.69 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  42.54 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  36.23 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  42.54 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  38.52 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  35.94 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  38.52 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  42.54 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  38.52 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  36.57 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  37.21 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  41.04 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  41.18 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  38.06 
 
 		 168 aa  95.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  38.76 
 
 		 165 aa  94.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  36.3 
 
 		 143 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  35.82 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  36.57 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  35.07 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  36.09 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  39.26 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  35.82 
 
 		 165 aa  91.3  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  35.29 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  31.34 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  36.57 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  36.57 
 
 		 169 aa  88.6  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  36.22 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1166  transcription antitermination protein NusB  35.94 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000379162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  40.35 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  35.54 
 
 		 134 aa  87.8  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  33.85 
 
 		 162 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  33.85 
 
 		 162 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  33.85 
 
 		 162 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  39.47 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  41.3 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  34.25 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  33.33 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  33.08 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  42.17 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  35.16 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  35.16 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  35.16 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  35.16 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  35.16 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  34.33 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  33.58 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  32.31 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  40.96 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  35.16 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  38.52 
 
 		 165 aa  84  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  35.56 
 
 		 138 aa  84.3  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  32.09 
 
 		 164 aa  84  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  32.61 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  36.84 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  34.38 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  36.84 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  35.66 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  32.61 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  44.58 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  35.29 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1074  transcription antitermination protein NusB  36.72 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547473  hitchhiker  0.000302454 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  30.43 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4049  NusB antitermination factor  32.33 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1100  transcription antitermination protein NusB  34.38 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000596608  normal  0.728168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1166  transcription antitermination protein NusB  34.38 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00313304  normal  0.241653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1100  transcription antitermination protein NusB  34.38 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000020777  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  44.58 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.705133 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  32.09 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  31.21 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1049  transcription antitermination protein NusB  38.35 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11450  transcription antitermination protein NusB  38.35 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0546593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  31.85 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1444  NusB antitermination factor  33.83 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1563  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3283  transcription antitermination protein NusB  34.38 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  32.61 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  32.84 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3454  transcription antitermination protein NusB  38.06 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262306 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  32.81 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  32.03 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  35.88 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  34.59 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  31.3 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>