More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1576 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 132 aa  263  4e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  98.48 
 
 		 132 aa  260  4e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  97.73 
 
 		 132 aa  257  4e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  65.89 
 
 		 131 aa  169  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0541  transcription antitermination protein NusB  61.42 
 
 		 132 aa  167  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  58.02 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  55.38 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1180  transcription antitermination protein NusB  58.27 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  53.79 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0784  transcription antitermination protein NusB  53.54 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  34.62 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  34.06 
 
 		 163 aa  83.6  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1532  transcription termination/antitermination factor NusB  38.17 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.318402  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  34.62 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  30.66 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  32.09 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  32.62 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  31.39 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  28.36 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  32.81 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  32.81 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  32.84 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  32.81 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  33.98 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  29.1 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  34.53 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  32.33 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  33.59 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  31.54 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  29.85 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  32.35 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0584  transcription antitermination protein NusB  34.68 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  33.06 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  36.15 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  28.57 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  29.23 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  32.26 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  35.07 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1100  transcription antitermination protein NusB  36.15 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000596608  normal  0.728168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1166  transcription antitermination protein NusB  36.15 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00313304  normal  0.241653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1100  transcription antitermination protein NusB  36.15 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000020777  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  31.62 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  30.23 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  29.85 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0603  transcription antitermination protein NusB  34.65 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.016248  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1444  NusB antitermination factor  31.58 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  35.61 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  29.23 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  37.08 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  30.71 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  31.25 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  41.98 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  41.98 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  36.09 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  30.66 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  31.3 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  28.47 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  29.85 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  31.62 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  34.85 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  38.2 
 
 		 154 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  30.91 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  32.06 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  31.25 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0803  NusB antitermination factor  34.96 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2897  transcription antitermination protein NusB  35.29 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  29.84 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1027  transcription antitermination protein NusB  35.29 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  28.37 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0301  transcription antitermination factor NusB  29.32 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3088  transcription antitermination protein NusB  35.29 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0477  NusB antitermination factor  29.32 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.144816  hitchhiker  0.000124521 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  34.59 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  40.24 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  27.4 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  32.59 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  29.55 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1166  transcription antitermination protein NusB  31.5 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000379162  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  30.6 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  31.54 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  28.68 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3256  transcription antitermination protein NusB  34.45 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  39.33 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  28.68 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3283  transcription antitermination protein NusB  34.45 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  28.68 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3115  transcription antitermination protein NusB  34.45 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3165  transcription antitermination protein NusB  34.45 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>