190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14710 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_14710  transcription antitermination factor NusB  100 
 
 		 178 aa  349  1e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655877  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  47.01 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  47.1 
 
 		 138 aa  111  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  43.07 
 
 		 138 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  46.46 
 
 		 136 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  42.75 
 
 		 136 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  42.54 
 
 		 138 aa  104  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  43.7 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  40.15 
 
 		 137 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  42.96 
 
 		 144 aa  101  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  41.79 
 
 		 136 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  41.54 
 
 		 139 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  43.18 
 
 		 135 aa  99  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  42.47 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  41.04 
 
 		 136 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  41.13 
 
 		 145 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  39.85 
 
 		 190 aa  95.1  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  38.46 
 
 		 142 aa  93.2  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  40.62 
 
 		 153 aa  91.3  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  41.73 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  39.1 
 
 		 163 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  38.93 
 
 		 135 aa  87.8  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  42.31 
 
 		 138 aa  87  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  37.59 
 
 		 167 aa  84.7  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  38.35 
 
 		 163 aa  84.3  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  38.41 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  38.41 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  40.16 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  38.41 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  38.35 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  40.44 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  40.31 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  39.1 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  35.82 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  34.88 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  40.3 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  35.51 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  39.18 
 
 		 135 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  29.03 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  37.33 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  32.85 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  33.83 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  39.29 
 
 		 135 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  31.34 
 
 		 140 aa  67  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  33.81 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  33.58 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  39.53 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  36.43 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  30.3 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2525  transcription antitermination protein NusB  31.79 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  35.66 
 
 		 142 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0770  transcription antitermination protein NusB  31.08 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  30.82 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0763  transcription antitermination protein NusB  31.08 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  29.03 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1286  NusB antitermination factor  26.19 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  34.33 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  29.63 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2438  NusB antitermination factor  38.61 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  36.84 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  24.79 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  26.67 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2471  transcription antitermination protein NusB  32.8 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.526539  hitchhiker  0.00000000554853 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  30.23 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  34.03 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  32.29 
 
 		 211 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  32.29 
 
 		 235 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.705133 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  38.16 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  41.33 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  32.41 
 
 		 148 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  38.16 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  37.65 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  33.68 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  36.62 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  35.85 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  38.16 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  36.78 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  36.05 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  37.33 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  38.57 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  25.98 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  33.71 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  32.97 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  33.71 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  33.71 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  33.71 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  33.71 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  33.71 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  33.71 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  33.71 
 
 		 130 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  30 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  33.71 
 
 		 130 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  35.16 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  26.81 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  24.81 
 
 		 129 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  24.81 
 
 		 129 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  25.83 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  32.58 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>