More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4342 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 209 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  58.16 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.705133 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  58.16 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  54.37 
 
 		 212 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0737  transcription antitermination protein NusB  57 
 
 		 207 aa  231  8.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2471  transcription antitermination protein NusB  57.36 
 
 		 213 aa  221  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.526539  hitchhiker  0.00000000554853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  54.31 
 
 		 211 aa  214  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1589  NusB antitermination factor  52.68 
 
 		 213 aa  209  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00091  transcription antitermination protein NusB  41.29 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0010  transcription antitermination protein NusB  40.1 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.728804  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1336  transcription antitermination protein NusB  36.32 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0010  transcription antitermination protein NusB  39.8 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00081  transcription antitermination protein NusB  35.82 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00081  transcription antitermination protein NusB  31.84 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0009  transcription antitermination protein NusB  32.18 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00081  transcription antitermination protein NusB  32.34 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.874807  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00081  transcription antitermination protein NusB  33.66 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00081  transcription antitermination protein NusB  31.34 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  39 
 
 		 142 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  39 
 
 		 142 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  39 
 
 		 142 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  40.82 
 
 		 151 aa  85.1  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  44.68 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  44.19 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  43.62 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  41.38 
 
 		 143 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  45.12 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  38.78 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  38.52 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  40.66 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  42.11 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  42.86 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  39.53 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  40.82 
 
 		 147 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  41.94 
 
 		 129 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  40.51 
 
 		 135 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  41.94 
 
 		 129 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  36 
 
 		 143 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  43.02 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  40.79 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  39.56 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  40.51 
 
 		 135 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  36.19 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  33.57 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  36.78 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  35.48 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  50.72 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  41.46 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  35.4 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  35.66 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  35.66 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  35.66 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  36.73 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  40.62 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  49.28 
 
 		 142 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  39.08 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2438  NusB antitermination factor  40 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  39.08 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  42.17 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  40.91 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  48.15 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  41.18 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  35.58 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  42.35 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  36.96 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  36.11 
 
 		 136 aa  72  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  37.93 
 
 		 130 aa  72  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  41.38 
 
 		 134 aa  72  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  33.98 
 
 		 144 aa  72  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  37.93 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  37.93 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  37.93 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  37.93 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  37.93 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  37.93 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  37.93 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  38.2 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  40.86 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  38.1 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  33.64 
 
 		 140 aa  70.9  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  40.45 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  39.56 
 
 		 132 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  41.86 
 
 		 138 aa  70.9  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  41.57 
 
 		 136 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  38.2 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  40.21 
 
 		 133 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  39.33 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  45.21 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  41.11 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  40 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  34.43 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  43.02 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  37.35 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  41.46 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  34.55 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  36.59 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  42.68 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  30.48 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  36.36 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>