More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1452 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 235 aa  417  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.705133 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  72.46 
 
 		 212 aa  311  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  58.16 
 
 		 209 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0737  transcription antitermination protein NusB  52.2 
 
 		 207 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  54.73 
 
 		 211 aa  223  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1589  NusB antitermination factor  54.76 
 
 		 213 aa  222  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2471  transcription antitermination protein NusB  53.23 
 
 		 213 aa  211  7.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.526539  hitchhiker  0.00000000554853 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00091  transcription antitermination protein NusB  40.28 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1336  transcription antitermination protein NusB  38.16 
 
 		 208 aa  137  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00081  transcription antitermination protein NusB  38.16 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0010  transcription antitermination protein NusB  40.59 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.728804  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0010  transcription antitermination protein NusB  38.73 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00081  transcription antitermination protein NusB  36.82 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149068 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00081  transcription antitermination protein NusB  36.14 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00081  transcription antitermination protein NusB  35 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.874807  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0009  transcription antitermination protein NusB  33 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00081  transcription antitermination protein NusB  32.84 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  50 
 
 		 160 aa  86.3  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  43.96 
 
 		 195 aa  85.5  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  44.68 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  44.58 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  44.58 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  42.39 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  42.39 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  42.39 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  45.88 
 
 		 143 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  45.88 
 
 		 142 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  42.68 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  46.99 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  41.94 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  45.12 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  45.12 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  43.96 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  41.11 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  43.53 
 
 		 143 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  51.28 
 
 		 145 aa  77.4  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  43.02 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  48.1 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  43.53 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  43.01 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  41.38 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  38.89 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  41.58 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  44.19 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  42.55 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  45.12 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  35 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  45.12 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  30.23 
 
 		 325 aa  75.5  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  43.01 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  45.12 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  41.86 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  44 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  45.57 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  40 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  43.18 
 
 		 136 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  37.29 
 
 		 144 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  39.77 
 
 		 139 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  35.16 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  34.43 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  45.57 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  44.44 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  41.94 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  41.94 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  43.9 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  40.22 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  42.68 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  36.84 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  38.2 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  37.38 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  38.95 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  41.94 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  41.94 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  41.94 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  41.94 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  41.94 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  41.94 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  41.38 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  42.05 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  41.94 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  40.23 
 
 		 169 aa  72  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  39.08 
 
 		 162 aa  72  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  44.32 
 
 		 132 aa  72  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  41.46 
 
 		 164 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  39.56 
 
 		 139 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  41.86 
 
 		 168 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  38.54 
 
 		 167 aa  71.2  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  39.33 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  36.89 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  38.89 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  40.48 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  43.9 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  39.29 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  37.78 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  34.44 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  39.08 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  39.33 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  36.27 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>