More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2471 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2471  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 213 aa  417  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.526539  hitchhiker  0.00000000554853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  57.36 
 
 		 209 aa  221  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0737  transcription antitermination protein NusB  55.1 
 
 		 207 aa  219  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  53.23 
 
 		 211 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  53.23 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.705133 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1589  NusB antitermination factor  50.72 
 
 		 213 aa  209  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  50 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  50.75 
 
 		 211 aa  194  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00091  transcription antitermination protein NusB  42.08 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0010  transcription antitermination protein NusB  43.4 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00081  transcription antitermination protein NusB  36.41 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00081  transcription antitermination protein NusB  39.6 
 
 		 211 aa  128  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149068 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0010  transcription antitermination protein NusB  42.86 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.728804  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00081  transcription antitermination protein NusB  38.12 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00081  transcription antitermination protein NusB  35.92 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.874807  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00081  transcription antitermination protein NusB  38.5 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1336  transcription antitermination protein NusB  38.5 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0009  transcription antitermination protein NusB  35.44 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  45.05 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  37.98 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  39.8 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  42.22 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  41.75 
 
 		 156 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  37.96 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  39.8 
 
 		 130 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  39.8 
 
 		 130 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  39.8 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  39.8 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  39.8 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  39.8 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  39.8 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  39.8 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  39.8 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  44.09 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  41.76 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  39.8 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  39.56 
 
 		 138 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  34.38 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  36.45 
 
 		 143 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  38.04 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  38.04 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  38.04 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  38.54 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  40.48 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  38.64 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  29.63 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  35.29 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  33.56 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  37.96 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  42.5 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  41.57 
 
 		 145 aa  68.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  43.82 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  35.61 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4924  NusB antitermination factor  40.82 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  37.36 
 
 		 138 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  27.89 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  40 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  37.76 
 
 		 133 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  42.35 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  42.2 
 
 		 145 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 132 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  38.89 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  36.89 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  32.12 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  47.46 
 
 		 325 aa  65.1  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  35.92 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  35.85 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  34.07 
 
 		 136 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  32.35 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  37.76 
 
 		 146 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  41.57 
 
 		 150 aa  64.7  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  32.35 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  35.96 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  43.48 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  34.41 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  39.77 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  31.53 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  39.76 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  38.1 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  39.77 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  36.36 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  42.03 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  40 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  38.64 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0107  transcription antitermination protein NusB  27.35 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  37.08 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  33.02 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  34.48 
 
 		 154 aa  62  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  35.16 
 
 		 165 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  34.15 
 
 		 154 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  32.53 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  28.1 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  37.76 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>