More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0276 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 211 aa  424  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1589  NusB antitermination factor  76.06 
 
 		 213 aa  320  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  54.73 
 
 		 235 aa  223  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.705133 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  54.73 
 
 		 211 aa  223  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  54.68 
 
 		 212 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0737  transcription antitermination protein NusB  56.44 
 
 		 207 aa  223  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  54.31 
 
 		 209 aa  214  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2471  transcription antitermination protein NusB  50.75 
 
 		 213 aa  194  8.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.526539  hitchhiker  0.00000000554853 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00091  transcription antitermination protein NusB  40.38 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00081  transcription antitermination protein NusB  36 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1336  transcription antitermination protein NusB  35.86 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0010  transcription antitermination protein NusB  39.51 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0010  transcription antitermination protein NusB  38 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.728804  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00081  transcription antitermination protein NusB  33.5 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.874807  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00081  transcription antitermination protein NusB  32.5 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0009  transcription antitermination protein NusB  33 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00081  transcription antitermination protein NusB  33.98 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149068 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00081  transcription antitermination protein NusB  32 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  44.21 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  42.45 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  37.37 
 
 		 136 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  36.55 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  46.07 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  44.19 
 
 		 151 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  50 
 
 		 145 aa  77.8  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  40.82 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  43 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  37.07 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  38.46 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  38.46 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  34.95 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  38.46 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  40.91 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  38.46 
 
 		 143 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  40.4 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  42 
 
 		 143 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  45.21 
 
 		 139 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  42.05 
 
 		 139 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  35.92 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  42.5 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  42.5 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  42.7 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  42.35 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  42 
 
 		 143 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  44.3 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  35.11 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  46.48 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  37.23 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  38.95 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  36.17 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  45.83 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  41.05 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  32.77 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  41.18 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  41.18 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  36.63 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  41.18 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  33.85 
 
 		 168 aa  72  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  36.04 
 
 		 138 aa  72  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  42.11 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  36.17 
 
 		 142 aa  71.2  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  43.53 
 
 		 145 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  42.86 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  42.86 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  37.21 
 
 		 145 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  33.04 
 
 		 143 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  42.7 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  38.82 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  43.66 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  39.33 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  41.3 
 
 		 146 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  38.78 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  35.71 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  39.53 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  38.61 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  45.16 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  38.2 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  38.3 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  39.33 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  40.23 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0541  transcription antitermination protein NusB  35.23 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  39.33 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  39.08 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  39.33 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  37.08 
 
 		 325 aa  68.6  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  36.99 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  36.67 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  41.89 
 
 		 143 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>