More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5041 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 212 aa  414  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  72.46 
 
 		 235 aa  312  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.705133 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  72.46 
 
 		 211 aa  311  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  54.37 
 
 		 209 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  54.68 
 
 		 211 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1589  NusB antitermination factor  54.93 
 
 		 213 aa  221  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0737  transcription antitermination protein NusB  54.19 
 
 		 207 aa  221  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2471  transcription antitermination protein NusB  50 
 
 		 213 aa  204  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.526539  hitchhiker  0.00000000554853 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00091  transcription antitermination protein NusB  42.16 
 
 		 211 aa  147  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1336  transcription antitermination protein NusB  39.7 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00081  transcription antitermination protein NusB  39.2 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0010  transcription antitermination protein NusB  41.35 
 
 		 211 aa  134  8e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.728804  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0010  transcription antitermination protein NusB  40.8 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00081  transcription antitermination protein NusB  37.75 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149068 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00081  transcription antitermination protein NusB  33.83 
 
 		 208 aa  128  6e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00081  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00081  transcription antitermination protein NusB  33.17 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.874807  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0009  transcription antitermination protein NusB  30.65 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  40.78 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  40.62 
 
 		 160 aa  85.5  6e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  43.3 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  43.62 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  41.84 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  39.58 
 
 		 136 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  39.18 
 
 		 142 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  36.84 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  34.13 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  40 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  38.78 
 
 		 142 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  38.78 
 
 		 142 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  40.45 
 
 		 154 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  38.78 
 
 		 142 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  37.76 
 
 		 151 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  39.39 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  50.75 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  39.56 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  31.75 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  34.15 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  38.78 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  39.8 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  37.36 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  44.32 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  34.96 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  49.25 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  34.09 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  38.2 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  39.77 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  35.63 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  39.76 
 
 		 147 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  42.86 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  37.36 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  53.97 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  53.97 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  53.97 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  53.97 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  53.97 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  38.78 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  53.97 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  53.97 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  43.18 
 
 		 136 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  37.93 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  41.18 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  32.67 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  53.97 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  53.97 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  37.65 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  50.75 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  35.16 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  37.65 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  33.59 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  38.54 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  33.59 
 
 		 138 aa  72  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  37.65 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  35.11 
 
 		 143 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  32.67 
 
 		 154 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  33.67 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  37.8 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  31.58 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  37.78 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  39.33 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  37.76 
 
 		 133 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  37.93 
 
 		 136 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  51.67 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  40 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  39.77 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  33.68 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  33.04 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  36.36 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  35 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  36.56 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  46.58 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  38.71 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  35.85 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  42.5 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  43.75 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2438  NusB antitermination factor  35.16 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>