223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0010 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0010  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 
211 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.728804  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0010  transcription antitermination protein NusB  76.67 
 
 
211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00091  transcription antitermination protein NusB  62.98 
 
 
211 aa  260  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1336  transcription antitermination protein NusB  58.05 
 
 
208 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00081  transcription antitermination protein NusB  58.05 
 
 
208 aa  223  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00081  transcription antitermination protein NusB  51.23 
 
 
208 aa  214  8e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00081  transcription antitermination protein NusB  50.72 
 
 
211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000149068 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00081  transcription antitermination protein NusB  51.72 
 
 
205 aa  211  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.874807  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00081  transcription antitermination protein NusB  50 
 
 
208 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0009  transcription antitermination protein NusB  47.29 
 
 
208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  40.8 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.705133 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  41.35 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  40.8 
 
 
211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2471  transcription antitermination protein NusB  42.86 
 
 
213 aa  137  8.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.526539  hitchhiker  0.00000000554853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  40.1 
 
 
209 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1589  NusB antitermination factor  38.76 
 
 
213 aa  129  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0737  transcription antitermination protein NusB  37.31 
 
 
207 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  38 
 
 
211 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  39.76 
 
 
130 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  39.76 
 
 
130 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  38.55 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  38.55 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  38.55 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  38.55 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  38.55 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  38.55 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  38.55 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  38.55 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  35 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  38.55 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  50 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  47.06 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  34.17 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  38.67 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  38.89 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  42.86 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  40.51 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  39.47 
 
 
148 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  39.73 
 
 
142 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  39.73 
 
 
142 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  36.36 
 
 
143 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  35.63 
 
 
143 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  39.73 
 
 
142 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  37.89 
 
 
147 aa  62.8  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 
133 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  44.29 
 
 
155 aa  62.4  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  44.3 
 
 
150 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  38.1 
 
 
147 aa  62.4  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  34.55 
 
 
143 aa  61.6  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  35.71 
 
 
135 aa  61.6  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  35.71 
 
 
138 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  43.08 
 
 
144 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  34.48 
 
 
142 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  33.61 
 
 
143 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  26.62 
 
 
325 aa  59.7  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  40.91 
 
 
129 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  40.91 
 
 
129 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  38.82 
 
 
195 aa  59.7  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  44.59 
 
 
162 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  44.59 
 
 
162 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  44.59 
 
 
162 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 
144 aa  59.3  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0424  NusB antitermination factor  39.19 
 
 
294 aa  58.9  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.518961  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  33.68 
 
 
162 aa  58.9  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  36.14 
 
 
145 aa  58.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  32.99 
 
 
139 aa  58.9  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  32.97 
 
 
145 aa  58.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  34.83 
 
 
154 aa  58.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  36.25 
 
 
143 aa  58.5  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  32.95 
 
 
134 aa  58.5  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  32.97 
 
 
145 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0750  transcription termination factor  32.53 
 
 
133 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.906803  hitchhiker  0.00118755 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1032  NusB antitermination factor  34.44 
 
 
127 aa  57.4  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  38.64 
 
 
160 aa  57.8  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4924  NusB antitermination factor  34.78 
 
 
388 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  32 
 
 
135 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  32 
 
 
135 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  44.78 
 
 
164 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  31.18 
 
 
138 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  39.68 
 
 
129 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  46.27 
 
 
163 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  37.23 
 
 
138 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  38.81 
 
 
144 aa  55.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  34.15 
 
 
154 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  38.89 
 
 
138 aa  55.8  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  31.62 
 
 
145 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  34.52 
 
 
138 aa  55.5  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0422  hypothetical protein  33.77 
 
 
378 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  34.23 
 
 
165 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  31.11 
 
 
132 aa  55.5  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1038  NusB antitermination factor  34.38 
 
 
148 aa  55.5  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000780031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  35.71 
 
 
151 aa  55.5  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1752  NusB antitermination factor  29.49 
 
 
130 aa  55.1  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  34.41 
 
 
139 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  34.57 
 
 
154 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  42.86 
 
 
165 aa  55.1  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  34.83 
 
 
156 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  39.13 
 
 
142 aa  54.7  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  37.88 
 
 
131 aa  54.3  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  34.41 
 
 
153 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>