183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1336 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1336  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 208 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00081  transcription antitermination protein NusB  98.08 
 
 		 208 aa  400  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00091  transcription antitermination protein NusB  59.13 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00081  transcription antitermination protein NusB  58.05 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149068 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0010  transcription antitermination protein NusB  58.05 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.728804  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0010  transcription antitermination protein NusB  54.15 
 
 		 211 aa  200  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00081  transcription antitermination protein NusB  50.48 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00081  transcription antitermination protein NusB  50 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.874807  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00081  transcription antitermination protein NusB  47.29 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0009  transcription antitermination protein NusB  46.08 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  39.7 
 
 		 212 aa  141  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  38.16 
 
 		 211 aa  137  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  38.16 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.705133 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2471  transcription antitermination protein NusB  38.5 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.526539  hitchhiker  0.00000000554853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  36.32 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  35.86 
 
 		 211 aa  121  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1589  NusB antitermination factor  34.16 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0737  transcription antitermination protein NusB  33.5 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  45.45 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  40.23 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  38.64 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  32.26 
 
 		 142 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  32.26 
 
 		 142 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  32.26 
 
 		 142 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  36.73 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  28.91 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  35.71 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  34.48 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  38.27 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  30.77 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  37.04 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  38.27 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  34.12 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  32.95 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  41.1 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  35.56 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  36.36 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  32.28 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  34.44 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  28.86 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  35.58 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  35.79 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  35.44 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  37.66 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  35.48 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  35.96 
 
 		 136 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  38.27 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  34.94 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  34.69 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  34.44 
 
 		 144 aa  57  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  33.64 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2438  NusB antitermination factor  34.12 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  27.82 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  34.18 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  34.18 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  34.94 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  34.18 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  33.68 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  40 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  36.99 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  34.18 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  34.18 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  34.18 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  34.18 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  34.18 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  34.18 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  34.18 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  30.68 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  35.71 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  36.25 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  34.69 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  31.46 
 
 		 325 aa  55.1  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  36.67 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  32.14 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4924  NusB antitermination factor  37.33 
 
 		 388 aa  55.1  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  37.08 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  35.85 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  31.18 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  34.07 
 
 		 138 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  35.45 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 142 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  33.33 
 
 		 138 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  32.22 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  31.11 
 
 		 136 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  34.29 
 
 		 129 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  32.97 
 
 		 141 aa  52.8  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  34.29 
 
 		 129 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  30.63 
 
 		 162 aa  52.8  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  35.23 
 
 		 138 aa  52.8  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 165 aa  52.4  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  36.36 
 
 		 135 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  31.87 
 
 		 137 aa  52  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  40.98 
 
 		 144 aa  52  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  30.77 
 
 		 153 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  33.7 
 
 		 139 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  33.05 
 
 		 136 aa  51.6  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  37.66 
 
 		 162 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  37.66 
 
 		 162 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  37.66 
 
 		 162 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  29.9 
 
 		 132 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>