More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1038 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1038  NusB antitermination factor  100 
 
 		 148 aa  289  7e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000780031  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  37.4 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  40.6 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  37.86 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  37.86 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  41.41 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  40 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  40.62 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  37.86 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  34.35 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  40.91 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  40.62 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  40.62 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  40.62 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  40.62 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  40.62 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  40.62 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  40.62 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  40.62 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  39.84 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  38.97 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  38.97 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  38.97 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  40.77 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  42.54 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  32.58 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  36.43 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  38.85 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  38.06 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  40.31 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  35.97 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  35.77 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  34.56 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  40.16 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  38.81 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  36.5 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  37.04 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  39.23 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  34.48 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  32.56 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  33.83 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  44.32 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  43.02 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  43.02 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  43.02 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  38.19 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  37.21 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  38.52 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  31.78 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  38.1 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  41.41 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  31.11 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  41.86 
 
 		 163 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  41.86 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  31.11 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  32.09 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  36.5 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  35.34 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  37.8 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  40.66 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  31.06 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  35.16 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  36.59 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  28.68 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  32.12 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  35.34 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  31.62 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  30.52 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  38.89 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  33.8 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1315  transcription antitermination protein NusB  38.57 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  38.24 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  32.85 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  35.25 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  32.82 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6247  NusB antitermination factor  33.68 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  35.34 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  34.29 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  32.58 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01422  transcription antitermination protein NusB  37.88 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0163631  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  34.38 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  31.11 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  37.86 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  41.05 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  31.5 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  35.38 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  38.89 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  36.3 
 
 		 167 aa  67  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  36.15 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  40.82 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  34.29 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  32.09 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  42.86 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  31.25 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  34.03 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  31.54 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  34.95 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  34.33 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  44.44 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  27.74 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>