More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1002 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1002  NusB antitermination factor  100 
 
 		 151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  32 
 
 		 165 aa  94  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  36.62 
 
 		 142 aa  90.9  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  35.92 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  31.13 
 
 		 154 aa  88.6  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  33.58 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  30.56 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  33.09 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  30.56 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  30.56 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  31.25 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  36.96 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  32.21 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  28.35 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  29.93 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  34.78 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  30.3 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  28.46 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  33.09 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  24.46 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  32.09 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  27.54 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  29.63 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  27.74 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  34.57 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  31.29 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  29.32 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  26.87 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1401  NusB/RsmB/TIM44  39.56 
 
 		 316 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979954 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  30.6 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  27.07 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  28.68 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  26.15 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  26.32 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  26.87 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0424  NusB antitermination factor  28.97 
 
 		 294 aa  73.9  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.518961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  26.67 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  28.46 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  26.87 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  28.24 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  32.53 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  34.57 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  29.32 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2664  transcription antitermination protein NusB  26.97 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0957434  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  29.23 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  31.3 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2025  NusB antitermination factor  26.39 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0100858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  32.47 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  32.18 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  25.18 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1819  transcription antitermination protein NusB  24.5 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  31.46 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  34.52 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2676  transcription antitermination protein NusB  26.81 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0143299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  29.77 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  37.14 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  26.19 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  31.48 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1315  transcription antitermination protein NusB  28.91 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3044  transcription antitermination protein NusB  22.3 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4458  transcription antitermination protein NusB  27.48 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  31.03 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1049  transcription antitermination protein NusB  30 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  27.86 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11450  transcription antitermination protein NusB  30 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0546593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  24.14 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  27.07 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6330  NusB antitermination factor  39.47 
 
 		 378 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3073  NusB antitermination factor  32.1 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  27.86 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  28.68 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0694  N utilization substance protein B  26.72 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  27.07 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  26.72 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  27.27 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  27.27 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0571  transcription antitermination protein NusB  30.08 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  26.67 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  27.27 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  30.83 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2639  transcription antitermination protein NusB  25 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.093311  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  31.58 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  28 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0518  transcription antitermination protein NusB  30.6 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.360149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0553  transcription antitermination protein NusB  30.6 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3165  transcription antitermination protein NusB  33.72 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3256  transcription antitermination protein NusB  33.72 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05376  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3115  transcription antitermination protein NusB  33.72 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  31.3 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  42.25 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3853  transcription antitermination protein NusB  30 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0564  transcription antitermination protein NusB  30.6 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1074  transcription antitermination protein NusB  44.26 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547473  hitchhiker  0.000302454 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  37.66 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4644  transcription antitermination protein NusB  24.49 
 
 		 169 aa  67  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187095  normal  0.435075 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  37.66 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  27.27 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3009  transcription antitermination protein NusB  26.09 
 
 		 174 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>